Protein–RNA interactions for Protein: P20033

Pdgfa, Platelet-derived growth factor subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfaP20033 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PdgfaP20033 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PdgfaP20033 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PdgfaP20033 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PdgfaP20033 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PdgfaP20033 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PdgfaP20033 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PdgfaP20033 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PdgfaP20033 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PdgfaP20033 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PdgfaP20033 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PdgfaP20033 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PdgfaP20033 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PdgfaP20033 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PdgfaP20033 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PdgfaP20033 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PdgfaP20033 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
PdgfaP20033 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PdgfaP20033 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
PdgfaP20033 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PdgfaP20033 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PdgfaP20033 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PdgfaP20033 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PdgfaP20033 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PdgfaP20033 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PdgfaP20033 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PdgfaP20033 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PdgfaP20033 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PdgfaP20033 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PdgfaP20033 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PdgfaP20033 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PdgfaP20033 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
PdgfaP20033 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PdgfaP20033 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PdgfaP20033 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PdgfaP20033 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PdgfaP20033 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PdgfaP20033 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PdgfaP20033 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PdgfaP20033 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PdgfaP20033 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
PdgfaP20033 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PdgfaP20033 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
PdgfaP20033 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PdgfaP20033 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PdgfaP20033 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PdgfaP20033 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PdgfaP20033 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PdgfaP20033 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PdgfaP20033 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PdgfaP20033 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PdgfaP20033 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PdgfaP20033 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PdgfaP20033 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PdgfaP20033 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PdgfaP20033 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
PdgfaP20033 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PdgfaP20033 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PdgfaP20033 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PdgfaP20033 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PdgfaP20033 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PdgfaP20033 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PdgfaP20033 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
PdgfaP20033 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PdgfaP20033 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PdgfaP20033 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PdgfaP20033 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PdgfaP20033 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PdgfaP20033 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PdgfaP20033 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PdgfaP20033 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PdgfaP20033 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PdgfaP20033 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PdgfaP20033 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PdgfaP20033 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PdgfaP20033 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PdgfaP20033 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PdgfaP20033 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PdgfaP20033 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PdgfaP20033 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
PdgfaP20033 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
PdgfaP20033 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
PdgfaP20033 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
PdgfaP20033 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
PdgfaP20033 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PdgfaP20033 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PdgfaP20033 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PdgfaP20033 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PdgfaP20033 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PdgfaP20033 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PdgfaP20033 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PdgfaP20033 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PdgfaP20033 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PdgfaP20033 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PdgfaP20033 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PdgfaP20033 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PdgfaP20033 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PdgfaP20033 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PdgfaP20033 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PdgfaP20033 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms