Protein–RNA interactions for Protein: P18530

Ig heavy chain V region 7-39, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18530 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
P18530 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
P18530 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
P18530 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
P18530 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
P18530 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
P18530 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
P18530 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
P18530 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
P18530 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
P18530 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
P18530 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
P18530 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
P18530 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
P18530 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
P18530 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
P18530 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
P18530 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
P18530 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
P18530 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
P18530 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
P18530 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
P18530 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
P18530 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
P18530 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
P18530 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
P18530 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
P18530 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
P18530 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
P18530 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
P18530 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
P18530 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
P18530 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
P18530 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
P18530 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
P18530 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
P18530 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
P18530 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
P18530 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
P18530 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
P18530 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
P18530 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
P18530 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
P18530 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
P18530 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
P18530 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
P18530 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
P18530 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
P18530 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
P18530 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
P18530 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
P18530 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
P18530 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
P18530 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
P18530 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
P18530 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
P18530 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
P18530 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
P18530 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
P18530 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
P18530 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
P18530 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
P18530 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
P18530 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
P18530 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
P18530 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
P18530 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
P18530 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
P18530 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
P18530 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
P18530 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
P18530 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
P18530 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
P18530 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
P18530 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
P18530 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
P18530 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
P18530 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
P18530 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
P18530 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
P18530 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
P18530 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
P18530 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
P18530 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
P18530 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
P18530 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
P18530 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
P18530 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
P18530 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
P18530 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
P18530 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
P18530 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
P18530 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
P18530 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
P18530 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
P18530 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
P18530 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
P18530 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
P18530 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
P18530 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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