Protein–RNA interactions for Protein: P18242

Ctsd, Cathepsin D, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsdP18242 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CtsdP18242 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CtsdP18242 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CtsdP18242 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CtsdP18242 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CtsdP18242 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
CtsdP18242 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CtsdP18242 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CtsdP18242 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CtsdP18242 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CtsdP18242 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CtsdP18242 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
CtsdP18242 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CtsdP18242 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CtsdP18242 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CtsdP18242 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CtsdP18242 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CtsdP18242 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CtsdP18242 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CtsdP18242 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CtsdP18242 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CtsdP18242 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CtsdP18242 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CtsdP18242 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CtsdP18242 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CtsdP18242 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
CtsdP18242 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
CtsdP18242 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
CtsdP18242 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CtsdP18242 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CtsdP18242 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CtsdP18242 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
CtsdP18242 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
CtsdP18242 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
CtsdP18242 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CtsdP18242 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CtsdP18242 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CtsdP18242 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CtsdP18242 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CtsdP18242 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CtsdP18242 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CtsdP18242 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CtsdP18242 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CtsdP18242 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CtsdP18242 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CtsdP18242 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CtsdP18242 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CtsdP18242 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CtsdP18242 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
CtsdP18242 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CtsdP18242 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CtsdP18242 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CtsdP18242 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CtsdP18242 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CtsdP18242 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CtsdP18242 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CtsdP18242 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CtsdP18242 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CtsdP18242 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CtsdP18242 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CtsdP18242 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CtsdP18242 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CtsdP18242 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
CtsdP18242 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CtsdP18242 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CtsdP18242 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CtsdP18242 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CtsdP18242 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
CtsdP18242 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
CtsdP18242 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
CtsdP18242 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CtsdP18242 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CtsdP18242 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CtsdP18242 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CtsdP18242 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CtsdP18242 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CtsdP18242 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CtsdP18242 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CtsdP18242 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CtsdP18242 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CtsdP18242 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CtsdP18242 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CtsdP18242 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CtsdP18242 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CtsdP18242 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CtsdP18242 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CtsdP18242 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CtsdP18242 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CtsdP18242 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CtsdP18242 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CtsdP18242 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CtsdP18242 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CtsdP18242 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CtsdP18242 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CtsdP18242 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
CtsdP18242 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
CtsdP18242 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
CtsdP18242 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CtsdP18242 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CtsdP18242 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms