Protein–RNA interactions for Protein: P15975

Usp53, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 53, mousemouse

Predictions only

Length 1,069 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp53P15975 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp53P15975 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp53P15975 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp53P15975 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp53P15975 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp53P15975 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp53P15975 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp53P15975 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp53P15975 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp53P15975 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp53P15975 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp53P15975 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp53P15975 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp53P15975 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp53P15975 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp53P15975 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp53P15975 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp53P15975 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp53P15975 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp53P15975 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp53P15975 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp53P15975 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp53P15975 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp53P15975 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp53P15975 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp53P15975 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp53P15975 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp53P15975 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp53P15975 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp53P15975 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp53P15975 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp53P15975 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp53P15975 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp53P15975 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp53P15975 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp53P15975 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp53P15975 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Usp53P15975 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Usp53P15975 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Usp53P15975 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Usp53P15975 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Usp53P15975 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Usp53P15975 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Usp53P15975 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Usp53P15975 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Usp53P15975 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp53P15975 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp53P15975 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp53P15975 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp53P15975 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp53P15975 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp53P15975 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp53P15975 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp53P15975 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp53P15975 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp53P15975 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp53P15975 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp53P15975 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp53P15975 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp53P15975 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp53P15975 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp53P15975 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp53P15975 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp53P15975 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp53P15975 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp53P15975 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp53P15975 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp53P15975 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp53P15975 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp53P15975 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp53P15975 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp53P15975 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp53P15975 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp53P15975 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp53P15975 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp53P15975 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp53P15975 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp53P15975 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp53P15975 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp53P15975 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp53P15975 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp53P15975 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp53P15975 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp53P15975 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp53P15975 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp53P15975 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp53P15975 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp53P15975 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp53P15975 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp53P15975 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp53P15975 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp53P15975 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp53P15975 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp53P15975 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp53P15975 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp53P15975 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp53P15975 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp53P15975 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp53P15975 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp53P15975 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms