Protein–RNA interactions for Protein: P14733

Lmnb1, Lamin-B1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmnb1P14733 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lmnb1P14733 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lmnb1P14733 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lmnb1P14733 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lmnb1P14733 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lmnb1P14733 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lmnb1P14733 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lmnb1P14733 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Lmnb1P14733 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Lmnb1P14733 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lmnb1P14733 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lmnb1P14733 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lmnb1P14733 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lmnb1P14733 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lmnb1P14733 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lmnb1P14733 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lmnb1P14733 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Lmnb1P14733 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lmnb1P14733 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lmnb1P14733 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lmnb1P14733 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Lmnb1P14733 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lmnb1P14733 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lmnb1P14733 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lmnb1P14733 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lmnb1P14733 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lmnb1P14733 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lmnb1P14733 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lmnb1P14733 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lmnb1P14733 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lmnb1P14733 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lmnb1P14733 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lmnb1P14733 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lmnb1P14733 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lmnb1P14733 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lmnb1P14733 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lmnb1P14733 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lmnb1P14733 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lmnb1P14733 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lmnb1P14733 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lmnb1P14733 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lmnb1P14733 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lmnb1P14733 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lmnb1P14733 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lmnb1P14733 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lmnb1P14733 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lmnb1P14733 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lmnb1P14733 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lmnb1P14733 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Lmnb1P14733 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Lmnb1P14733 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lmnb1P14733 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lmnb1P14733 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lmnb1P14733 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lmnb1P14733 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lmnb1P14733 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lmnb1P14733 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lmnb1P14733 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lmnb1P14733 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lmnb1P14733 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lmnb1P14733 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lmnb1P14733 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lmnb1P14733 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lmnb1P14733 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lmnb1P14733 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lmnb1P14733 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lmnb1P14733 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lmnb1P14733 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lmnb1P14733 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lmnb1P14733 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lmnb1P14733 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lmnb1P14733 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lmnb1P14733 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Lmnb1P14733 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lmnb1P14733 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Lmnb1P14733 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lmnb1P14733 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lmnb1P14733 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lmnb1P14733 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lmnb1P14733 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lmnb1P14733 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lmnb1P14733 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Lmnb1P14733 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lmnb1P14733 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lmnb1P14733 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lmnb1P14733 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lmnb1P14733 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lmnb1P14733 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lmnb1P14733 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lmnb1P14733 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lmnb1P14733 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lmnb1P14733 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lmnb1P14733 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lmnb1P14733 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lmnb1P14733 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lmnb1P14733 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lmnb1P14733 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lmnb1P14733 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lmnb1P14733 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lmnb1P14733 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms