Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.3 ms