Protein–RNA interactions for Protein: P12657

Chrm1, Muscarinic acetylcholine receptor M1, mousemouse

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrm1P12657 9930120I10Rik-201ENSMUST00000203027 865 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Chrm1P12657 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chrm1P12657 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Chrm1P12657 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Chrm1P12657 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Chrm1P12657 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chrm1P12657 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chrm1P12657 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chrm1P12657 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chrm1P12657 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chrm1P12657 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chrm1P12657 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chrm1P12657 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chrm1P12657 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chrm1P12657 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chrm1P12657 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chrm1P12657 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chrm1P12657 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chrm1P12657 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chrm1P12657 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Chrm1P12657 Gm6741-201ENSMUST00000057074 1330 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chrm1P12657 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chrm1P12657 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chrm1P12657 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chrm1P12657 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chrm1P12657 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chrm1P12657 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chrm1P12657 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chrm1P12657 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chrm1P12657 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chrm1P12657 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chrm1P12657 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chrm1P12657 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chrm1P12657 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chrm1P12657 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chrm1P12657 Gm24590-201ENSMUST00000116699 119 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Chrm1P12657 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chrm1P12657 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chrm1P12657 Vmn1r169-201ENSMUST00000170290 915 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chrm1P12657 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chrm1P12657 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chrm1P12657 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chrm1P12657 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chrm1P12657 CT025526.1-201ENSMUST00000217327 267 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Chrm1P12657 Gm17611-202ENSMUST00000220613 814 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Chrm1P12657 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Chrm1P12657 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chrm1P12657 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chrm1P12657 Gm37234-201ENSMUST00000193259 1441 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Chrm1P12657 Gm45832-201ENSMUST00000212762 1443 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Chrm1P12657 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chrm1P12657 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chrm1P12657 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chrm1P12657 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chrm1P12657 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Chrm1P12657 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chrm1P12657 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chrm1P12657 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chrm1P12657 4930518I15Rik-201ENSMUST00000099141 1331 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chrm1P12657 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chrm1P12657 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chrm1P12657 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chrm1P12657 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chrm1P12657 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chrm1P12657 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chrm1P12657 Gm26831-201ENSMUST00000181458 1380 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Chrm1P12657 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chrm1P12657 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chrm1P12657 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chrm1P12657 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chrm1P12657 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chrm1P12657 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chrm1P12657 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chrm1P12657 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chrm1P12657 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chrm1P12657 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chrm1P12657 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Chrm1P12657 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chrm1P12657 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chrm1P12657 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chrm1P12657 Gm15445-201ENSMUST00000146700 603 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chrm1P12657 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Chrm1P12657 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chrm1P12657 Gm26671-201ENSMUST00000180423 1157 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chrm1P12657 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chrm1P12657 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chrm1P12657 Gm37867-201ENSMUST00000192066 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chrm1P12657 Gm42947-201ENSMUST00000198230 675 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chrm1P12657 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chrm1P12657 Gm43761-201ENSMUST00000202132 991 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Chrm1P12657 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chrm1P12657 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chrm1P12657 Clec4a2-201ENSMUST00000032248 1261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chrm1P12657 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chrm1P12657 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chrm1P12657 Klrc2-201ENSMUST00000071920 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chrm1P12657 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chrm1P12657 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chrm1P12657 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chrm1P12657 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms