Protein–RNA interactions for Protein: P11983

Tcp1, T-complex protein 1 subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcp1P11983 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tcp1P11983 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tcp1P11983 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tcp1P11983 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tcp1P11983 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tcp1P11983 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tcp1P11983 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tcp1P11983 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tcp1P11983 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Tcp1P11983 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tcp1P11983 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tcp1P11983 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tcp1P11983 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tcp1P11983 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tcp1P11983 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tcp1P11983 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tcp1P11983 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tcp1P11983 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tcp1P11983 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tcp1P11983 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tcp1P11983 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tcp1P11983 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tcp1P11983 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tcp1P11983 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tcp1P11983 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tcp1P11983 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tcp1P11983 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tcp1P11983 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tcp1P11983 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tcp1P11983 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tcp1P11983 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tcp1P11983 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tcp1P11983 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tcp1P11983 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tcp1P11983 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tcp1P11983 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Tcp1P11983 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tcp1P11983 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tcp1P11983 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tcp1P11983 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tcp1P11983 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tcp1P11983 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tcp1P11983 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tcp1P11983 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tcp1P11983 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tcp1P11983 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tcp1P11983 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tcp1P11983 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tcp1P11983 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tcp1P11983 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tcp1P11983 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tcp1P11983 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tcp1P11983 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tcp1P11983 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tcp1P11983 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tcp1P11983 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tcp1P11983 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tcp1P11983 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tcp1P11983 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tcp1P11983 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tcp1P11983 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tcp1P11983 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tcp1P11983 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tcp1P11983 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tcp1P11983 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tcp1P11983 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tcp1P11983 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tcp1P11983 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tcp1P11983 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tcp1P11983 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tcp1P11983 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tcp1P11983 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tcp1P11983 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tcp1P11983 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Tcp1P11983 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tcp1P11983 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tcp1P11983 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Tcp1P11983 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Tcp1P11983 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tcp1P11983 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tcp1P11983 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tcp1P11983 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tcp1P11983 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tcp1P11983 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tcp1P11983 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Tcp1P11983 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Tcp1P11983 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
Tcp1P11983 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Tcp1P11983 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Tcp1P11983 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Tcp1P11983 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tcp1P11983 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tcp1P11983 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tcp1P11983 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tcp1P11983 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tcp1P11983 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tcp1P11983 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tcp1P11983 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tcp1P11983 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tcp1P11983 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms