Protein–RNA interactions for Protein: P11531

Dmd, Dystrophin, mousemouse

Predictions only

Length 3,678 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DmdP11531 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
DmdP11531 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
DmdP11531 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
DmdP11531 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
DmdP11531 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
DmdP11531 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
DmdP11531 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
DmdP11531 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
DmdP11531 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
DmdP11531 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
DmdP11531 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
DmdP11531 Gm44999-201ENSMUST00000207456 1493 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
DmdP11531 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
DmdP11531 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
DmdP11531 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
DmdP11531 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
DmdP11531 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
DmdP11531 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
DmdP11531 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
DmdP11531 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.3
DmdP11531 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
DmdP11531 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.3
DmdP11531 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
DmdP11531 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
DmdP11531 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
DmdP11531 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
DmdP11531 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
DmdP11531 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
DmdP11531 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
DmdP11531 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
DmdP11531 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
DmdP11531 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
DmdP11531 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
DmdP11531 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
DmdP11531 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
DmdP11531 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
DmdP11531 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
DmdP11531 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
DmdP11531 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
DmdP11531 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
DmdP11531 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
DmdP11531 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
DmdP11531 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
DmdP11531 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
DmdP11531 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
DmdP11531 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
DmdP11531 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
DmdP11531 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
DmdP11531 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
DmdP11531 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
DmdP11531 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
DmdP11531 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
DmdP11531 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
DmdP11531 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
DmdP11531 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
DmdP11531 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
DmdP11531 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
DmdP11531 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
DmdP11531 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
DmdP11531 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
DmdP11531 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
DmdP11531 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
DmdP11531 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
DmdP11531 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
DmdP11531 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
DmdP11531 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
DmdP11531 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
DmdP11531 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
DmdP11531 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
DmdP11531 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
DmdP11531 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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DmdP11531 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
DmdP11531 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
DmdP11531 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
DmdP11531 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
DmdP11531 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
DmdP11531 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
DmdP11531 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
DmdP11531 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
DmdP11531 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
DmdP11531 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
DmdP11531 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
DmdP11531 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
DmdP11531 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
DmdP11531 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
DmdP11531 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
DmdP11531 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
DmdP11531 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
DmdP11531 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
DmdP11531 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
DmdP11531 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
DmdP11531 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
DmdP11531 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
DmdP11531 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
DmdP11531 Higd1c-201ENSMUST00000175683 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
DmdP11531 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
DmdP11531 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
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