Protein–RNA interactions for Protein: P0DN90

Tmem254b, Transmembrane protein 254b, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem254bP0DN90 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Tmem254bP0DN90 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
Tmem254bP0DN90 Plin4-202ENSMUST00000190703 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Tmem254bP0DN90 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Tmem254bP0DN90 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC8.7□□□□□ -1.02
Tmem254bP0DN90 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Tmem254bP0DN90 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Tmem254bP0DN90 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Tmem254bP0DN90 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Tmem254bP0DN90 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
Tmem254bP0DN90 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
Tmem254bP0DN90 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Tmem254bP0DN90 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Tmem254bP0DN90 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Tmem254bP0DN90 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Tmem254bP0DN90 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Tmem254bP0DN90 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Tmem254bP0DN90 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
Tmem254bP0DN90 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Tmem254bP0DN90 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
Tmem254bP0DN90 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Tmem254bP0DN90 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Tmem254bP0DN90 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Tmem254bP0DN90 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Tmem254bP0DN90 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC8.7□□□□□ -1.02
Tmem254bP0DN90 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
Tmem254bP0DN90 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
Tmem254bP0DN90 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Tmem254bP0DN90 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Tmem254bP0DN90 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
Tmem254bP0DN90 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Tmem254bP0DN90 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
Tmem254bP0DN90 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Tmem254bP0DN90 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Tmem254bP0DN90 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Tmem254bP0DN90 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Tmem254bP0DN90 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Tmem254bP0DN90 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
Tmem254bP0DN90 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
Tmem254bP0DN90 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Tmem254bP0DN90 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
Tmem254bP0DN90 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Tmem254bP0DN90 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Tmem254bP0DN90 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Tmem254bP0DN90 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
Tmem254bP0DN90 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Tmem254bP0DN90 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Tmem254bP0DN90 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Tmem254bP0DN90 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Tmem254bP0DN90 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
Tmem254bP0DN90 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Tmem254bP0DN90 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
Tmem254bP0DN90 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Tmem254bP0DN90 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.69□□□□□ -1.02
Tmem254bP0DN90 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
Tmem254bP0DN90 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
Tmem254bP0DN90 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Tmem254bP0DN90 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
Tmem254bP0DN90 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Tmem254bP0DN90 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Tmem254bP0DN90 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Tmem254bP0DN90 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Tmem254bP0DN90 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Tmem254bP0DN90 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
Tmem254bP0DN90 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Tmem254bP0DN90 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.69□□□□□ -1.02
Tmem254bP0DN90 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
Tmem254bP0DN90 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
Tmem254bP0DN90 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Tmem254bP0DN90 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC8.69□□□□□ -1.02
Tmem254bP0DN90 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
Tmem254bP0DN90 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Tmem254bP0DN90 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
Tmem254bP0DN90 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Tmem254bP0DN90 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC8.69□□□□□ -1.02
Tmem254bP0DN90 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.69□□□□□ -1.02
Tmem254bP0DN90 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Tmem254bP0DN90 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
Tmem254bP0DN90 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Tmem254bP0DN90 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Tmem254bP0DN90 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
Tmem254bP0DN90 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Tmem254bP0DN90 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Tmem254bP0DN90 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Tmem254bP0DN90 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.69□□□□□ -1.02
Tmem254bP0DN90 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Tmem254bP0DN90 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Tmem254bP0DN90 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Tmem254bP0DN90 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Tmem254bP0DN90 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Tmem254bP0DN90 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Tmem254bP0DN90 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
Tmem254bP0DN90 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
Tmem254bP0DN90 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Tmem254bP0DN90 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Tmem254bP0DN90 Ehbp1-202ENSMUST00000109563 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Tmem254bP0DN90 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Tmem254bP0DN90 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Tmem254bP0DN90 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Tmem254bP0DN90 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms