Protein–RNA interactions for Protein: P0C7N9

Psmg4, Proteasome assembly chaperone 4, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmg4P0C7N9 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Psmg4P0C7N9 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Psmg4P0C7N9 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Psmg4P0C7N9 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Psmg4P0C7N9 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Psmg4P0C7N9 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Psmg4P0C7N9 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Psmg4P0C7N9 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Psmg4P0C7N9 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Psmg4P0C7N9 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Psmg4P0C7N9 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Psmg4P0C7N9 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Psmg4P0C7N9 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Psmg4P0C7N9 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Psmg4P0C7N9 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Psmg4P0C7N9 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Psmg4P0C7N9 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Psmg4P0C7N9 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Psmg4P0C7N9 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Psmg4P0C7N9 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Psmg4P0C7N9 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Psmg4P0C7N9 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Psmg4P0C7N9 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Psmg4P0C7N9 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Psmg4P0C7N9 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Psmg4P0C7N9 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Psmg4P0C7N9 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Psmg4P0C7N9 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Psmg4P0C7N9 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Psmg4P0C7N9 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Psmg4P0C7N9 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Psmg4P0C7N9 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Psmg4P0C7N9 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Psmg4P0C7N9 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Psmg4P0C7N9 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Psmg4P0C7N9 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Psmg4P0C7N9 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Psmg4P0C7N9 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Psmg4P0C7N9 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Psmg4P0C7N9 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Psmg4P0C7N9 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Psmg4P0C7N9 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Psmg4P0C7N9 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Psmg4P0C7N9 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Psmg4P0C7N9 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Psmg4P0C7N9 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Psmg4P0C7N9 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Psmg4P0C7N9 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Psmg4P0C7N9 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Psmg4P0C7N9 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Psmg4P0C7N9 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Psmg4P0C7N9 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Psmg4P0C7N9 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Psmg4P0C7N9 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Psmg4P0C7N9 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Psmg4P0C7N9 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Psmg4P0C7N9 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Psmg4P0C7N9 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Psmg4P0C7N9 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Psmg4P0C7N9 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Psmg4P0C7N9 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Psmg4P0C7N9 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Psmg4P0C7N9 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Psmg4P0C7N9 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Psmg4P0C7N9 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Psmg4P0C7N9 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Psmg4P0C7N9 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Psmg4P0C7N9 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Psmg4P0C7N9 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Psmg4P0C7N9 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Psmg4P0C7N9 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Psmg4P0C7N9 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Psmg4P0C7N9 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Psmg4P0C7N9 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Psmg4P0C7N9 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Psmg4P0C7N9 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Psmg4P0C7N9 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Psmg4P0C7N9 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Psmg4P0C7N9 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Psmg4P0C7N9 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Psmg4P0C7N9 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Psmg4P0C7N9 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Psmg4P0C7N9 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Psmg4P0C7N9 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Psmg4P0C7N9 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Psmg4P0C7N9 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Psmg4P0C7N9 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Psmg4P0C7N9 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Psmg4P0C7N9 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Psmg4P0C7N9 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Psmg4P0C7N9 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Psmg4P0C7N9 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Psmg4P0C7N9 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Psmg4P0C7N9 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Psmg4P0C7N9 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Psmg4P0C7N9 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Psmg4P0C7N9 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Psmg4P0C7N9 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Psmg4P0C7N9 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Psmg4P0C7N9 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms