Protein–RNA interactions for Protein: P09055

Itgb1, Integrin beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb1P09055 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Itgb1P09055 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Itgb1P09055 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Itgb1P09055 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Itgb1P09055 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Itgb1P09055 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Itgb1P09055 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Itgb1P09055 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Itgb1P09055 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Itgb1P09055 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Itgb1P09055 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Itgb1P09055 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Itgb1P09055 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Itgb1P09055 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Itgb1P09055 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Itgb1P09055 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Itgb1P09055 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Itgb1P09055 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Itgb1P09055 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Itgb1P09055 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Itgb1P09055 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Itgb1P09055 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Itgb1P09055 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Itgb1P09055 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Itgb1P09055 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Itgb1P09055 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Itgb1P09055 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Itgb1P09055 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Itgb1P09055 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Itgb1P09055 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Itgb1P09055 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Itgb1P09055 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Itgb1P09055 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Itgb1P09055 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Itgb1P09055 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Itgb1P09055 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Itgb1P09055 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Itgb1P09055 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Itgb1P09055 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Itgb1P09055 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Itgb1P09055 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Itgb1P09055 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Itgb1P09055 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Itgb1P09055 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Itgb1P09055 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Itgb1P09055 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Itgb1P09055 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Itgb1P09055 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Itgb1P09055 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Itgb1P09055 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Itgb1P09055 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Itgb1P09055 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Itgb1P09055 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Itgb1P09055 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Itgb1P09055 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Itgb1P09055 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Itgb1P09055 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Itgb1P09055 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Itgb1P09055 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Itgb1P09055 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Itgb1P09055 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Itgb1P09055 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Itgb1P09055 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Itgb1P09055 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Itgb1P09055 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Itgb1P09055 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Itgb1P09055 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Itgb1P09055 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Itgb1P09055 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Itgb1P09055 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Itgb1P09055 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Itgb1P09055 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Itgb1P09055 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Itgb1P09055 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Itgb1P09055 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Itgb1P09055 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Itgb1P09055 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Itgb1P09055 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Itgb1P09055 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Itgb1P09055 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Itgb1P09055 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Itgb1P09055 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Itgb1P09055 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Itgb1P09055 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Itgb1P09055 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Itgb1P09055 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Itgb1P09055 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Itgb1P09055 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Itgb1P09055 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Itgb1P09055 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Itgb1P09055 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Itgb1P09055 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Itgb1P09055 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Itgb1P09055 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Itgb1P09055 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Itgb1P09055 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Itgb1P09055 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Itgb1P09055 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Itgb1P09055 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Itgb1P09055 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.9 ms