Protein–RNA interactions for Protein: P09024

Hoxb7, Homeobox protein Hox-B7, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb7P09024 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxb7P09024 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxb7P09024 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxb7P09024 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxb7P09024 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxb7P09024 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxb7P09024 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxb7P09024 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxb7P09024 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxb7P09024 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxb7P09024 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxb7P09024 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxb7P09024 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxb7P09024 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxb7P09024 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxb7P09024 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxb7P09024 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxb7P09024 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxb7P09024 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxb7P09024 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxb7P09024 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxb7P09024 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxb7P09024 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxb7P09024 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxb7P09024 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxb7P09024 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxb7P09024 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxb7P09024 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxb7P09024 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxb7P09024 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxb7P09024 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxb7P09024 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxb7P09024 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxb7P09024 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxb7P09024 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxb7P09024 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxb7P09024 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxb7P09024 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxb7P09024 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxb7P09024 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxb7P09024 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxb7P09024 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxb7P09024 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxb7P09024 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxb7P09024 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxb7P09024 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxb7P09024 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxb7P09024 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxb7P09024 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxb7P09024 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxb7P09024 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxb7P09024 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxb7P09024 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxb7P09024 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxb7P09024 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxb7P09024 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxb7P09024 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxb7P09024 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxb7P09024 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxb7P09024 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxb7P09024 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxb7P09024 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxb7P09024 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxb7P09024 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxb7P09024 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxb7P09024 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxb7P09024 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxb7P09024 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxb7P09024 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxb7P09024 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxb7P09024 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxb7P09024 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxb7P09024 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxb7P09024 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxb7P09024 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxb7P09024 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxb7P09024 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxb7P09024 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxb7P09024 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxb7P09024 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxb7P09024 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxb7P09024 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxb7P09024 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxb7P09024 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxb7P09024 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxb7P09024 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxb7P09024 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxb7P09024 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxb7P09024 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxb7P09024 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxb7P09024 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxb7P09024 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxb7P09024 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxb7P09024 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxb7P09024 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxb7P09024 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxb7P09024 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxb7P09024 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxb7P09024 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxb7P09024 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms