Protein–RNA interactions for Protein: P06804

Tnf, Tumor necrosis factor, mousemouse

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Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnfP06804 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TnfP06804 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TnfP06804 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TnfP06804 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TnfP06804 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TnfP06804 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TnfP06804 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TnfP06804 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TnfP06804 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TnfP06804 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TnfP06804 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TnfP06804 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TnfP06804 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TnfP06804 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TnfP06804 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TnfP06804 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TnfP06804 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
TnfP06804 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TnfP06804 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TnfP06804 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TnfP06804 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TnfP06804 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TnfP06804 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TnfP06804 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
TnfP06804 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TnfP06804 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TnfP06804 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TnfP06804 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TnfP06804 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TnfP06804 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TnfP06804 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TnfP06804 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TnfP06804 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TnfP06804 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TnfP06804 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TnfP06804 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TnfP06804 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TnfP06804 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TnfP06804 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TnfP06804 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TnfP06804 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TnfP06804 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TnfP06804 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TnfP06804 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TnfP06804 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TnfP06804 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TnfP06804 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TnfP06804 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
TnfP06804 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TnfP06804 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
TnfP06804 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TnfP06804 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TnfP06804 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
TnfP06804 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TnfP06804 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
TnfP06804 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TnfP06804 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TnfP06804 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TnfP06804 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TnfP06804 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TnfP06804 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TnfP06804 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TnfP06804 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TnfP06804 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TnfP06804 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TnfP06804 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TnfP06804 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TnfP06804 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TnfP06804 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TnfP06804 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TnfP06804 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TnfP06804 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TnfP06804 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TnfP06804 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TnfP06804 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
TnfP06804 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TnfP06804 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TnfP06804 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TnfP06804 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TnfP06804 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TnfP06804 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TnfP06804 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TnfP06804 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TnfP06804 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TnfP06804 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TnfP06804 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TnfP06804 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
TnfP06804 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TnfP06804 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
TnfP06804 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TnfP06804 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TnfP06804 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TnfP06804 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
TnfP06804 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TnfP06804 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TnfP06804 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
TnfP06804 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
TnfP06804 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TnfP06804 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
TnfP06804 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms