Protein–RNA interactions for Protein: P01738

T-cell receptor alpha chain V region PHDS58, mousemouse

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Length 130 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01738 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01738 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01738 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01738 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01738 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01738 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01738 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01738 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01738 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01738 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01738 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01738 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01738 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01738 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01738 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01738 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01738 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
P01738 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01738 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01738 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01738 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01738 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01738 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01738 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01738 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01738 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01738 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01738 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01738 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01738 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
P01738 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01738 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01738 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01738 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01738 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01738 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01738 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01738 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01738 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01738 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01738 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
P01738 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01738 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01738 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01738 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01738 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01738 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01738 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01738 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01738 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01738 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01738 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01738 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01738 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01738 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01738 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01738 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01738 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01738 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01738 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01738 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01738 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01738 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01738 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01738 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01738 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
P01738 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01738 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01738 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01738 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01738 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01738 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
P01738 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01738 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01738 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01738 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01738 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
P01738 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01738 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01738 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01738 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01738 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
P01738 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01738 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01738 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01738 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01738 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01738 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01738 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01738 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01738 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01738 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01738 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01738 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01738 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01738 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
P01738 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01738 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01738 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01738 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
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