Protein–RNA interactions for Protein: P01649

Ig kappa chain V-V regions, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01649 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
P01649 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P01649 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
P01649 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
P01649 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
P01649 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P01649 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
P01649 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P01649 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
P01649 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P01649 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
P01649 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P01649 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
P01649 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
P01649 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
P01649 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
P01649 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
P01649 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
P01649 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
P01649 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
P01649 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
P01649 Gm11361-201ENSMUST00000223428 607 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
P01649 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P01649 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
P01649 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P01649 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P01649 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
P01649 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P01649 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
P01649 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P01649 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P01649 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
P01649 Gm37744-201ENSMUST00000194616 1590 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
P01649 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P01649 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P01649 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P01649 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01649 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01649 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01649 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01649 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01649 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01649 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01649 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01649 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01649 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01649 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01649 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01649 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01649 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01649 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01649 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01649 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01649 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01649 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01649 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01649 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01649 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01649 Gm20614-201ENSMUST00000177106 632 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
P01649 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01649 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01649 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01649 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01649 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01649 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01649 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01649 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01649 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01649 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01649 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
P01649 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
P01649 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
P01649 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01649 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01649 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01649 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01649 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01649 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01649 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01649 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01649 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01649 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01649 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01649 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01649 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01649 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01649 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01649 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01649 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01649 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01649 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01649 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01649 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
P01649 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01649 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01649 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01649 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
P01649 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01649 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01649 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms