Protein–RNA interactions for Protein: P01575

Ifnb1, Interferon beta, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifnb1P01575 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ifnb1P01575 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ifnb1P01575 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ifnb1P01575 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ifnb1P01575 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ifnb1P01575 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ifnb1P01575 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ifnb1P01575 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ifnb1P01575 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ifnb1P01575 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ifnb1P01575 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ifnb1P01575 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ifnb1P01575 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ifnb1P01575 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ifnb1P01575 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ifnb1P01575 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ifnb1P01575 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ifnb1P01575 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ifnb1P01575 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ifnb1P01575 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ifnb1P01575 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ifnb1P01575 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ifnb1P01575 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ifnb1P01575 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ifnb1P01575 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ifnb1P01575 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ifnb1P01575 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ifnb1P01575 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ifnb1P01575 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ifnb1P01575 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ifnb1P01575 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ifnb1P01575 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ifnb1P01575 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ifnb1P01575 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ifnb1P01575 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ifnb1P01575 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ifnb1P01575 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ifnb1P01575 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ifnb1P01575 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ifnb1P01575 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ifnb1P01575 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ifnb1P01575 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ifnb1P01575 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ifnb1P01575 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ifnb1P01575 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ifnb1P01575 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ifnb1P01575 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ifnb1P01575 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ifnb1P01575 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ifnb1P01575 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ifnb1P01575 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ifnb1P01575 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ifnb1P01575 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ifnb1P01575 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ifnb1P01575 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ifnb1P01575 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ifnb1P01575 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ifnb1P01575 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ifnb1P01575 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ifnb1P01575 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ifnb1P01575 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ifnb1P01575 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ifnb1P01575 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ifnb1P01575 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ifnb1P01575 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ifnb1P01575 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ifnb1P01575 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ifnb1P01575 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ifnb1P01575 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ifnb1P01575 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ifnb1P01575 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ifnb1P01575 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ifnb1P01575 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ifnb1P01575 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ifnb1P01575 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ifnb1P01575 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ifnb1P01575 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ifnb1P01575 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ifnb1P01575 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ifnb1P01575 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ifnb1P01575 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ifnb1P01575 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ifnb1P01575 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ifnb1P01575 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ifnb1P01575 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ifnb1P01575 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ifnb1P01575 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ifnb1P01575 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ifnb1P01575 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ifnb1P01575 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ifnb1P01575 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ifnb1P01575 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ifnb1P01575 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ifnb1P01575 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ifnb1P01575 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ifnb1P01575 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ifnb1P01575 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ifnb1P01575 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ifnb1P01575 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ifnb1P01575 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms