Protein–RNA interactions for Protein: O70401

Tspan6, Tetraspanin-6, mousemouse

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Length 245 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Tspan6O70401 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tspan6O70401 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Tspan6O70401 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tspan6O70401 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tspan6O70401 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tspan6O70401 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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Tspan6O70401 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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Tspan6O70401 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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Tspan6O70401 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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Tspan6O70401 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tspan6O70401 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tspan6O70401 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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Tspan6O70401 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tspan6O70401 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
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Tspan6O70401 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tspan6O70401 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tspan6O70401 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tspan6O70401 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tspan6O70401 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tspan6O70401 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tspan6O70401 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tspan6O70401 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tspan6O70401 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tspan6O70401 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Tspan6O70401 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tspan6O70401 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Tspan6O70401 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Tspan6O70401 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tspan6O70401 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
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