Protein–RNA interactions for Protein: O55203

Ldb2, LIM domain-binding protein 2, mousemouse

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Length 373 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb2O55203 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ldb2O55203 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ldb2O55203 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ldb2O55203 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ldb2O55203 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ldb2O55203 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ldb2O55203 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ldb2O55203 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ldb2O55203 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ldb2O55203 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ldb2O55203 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ldb2O55203 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ldb2O55203 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ldb2O55203 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ldb2O55203 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ldb2O55203 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ldb2O55203 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ldb2O55203 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Ldb2O55203 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Ldb2O55203 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ldb2O55203 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ldb2O55203 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ldb2O55203 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ldb2O55203 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ldb2O55203 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Ldb2O55203 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ldb2O55203 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ldb2O55203 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Ldb2O55203 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ldb2O55203 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ldb2O55203 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ldb2O55203 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ldb2O55203 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ldb2O55203 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ldb2O55203 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ldb2O55203 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ldb2O55203 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ldb2O55203 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ldb2O55203 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ldb2O55203 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ldb2O55203 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ldb2O55203 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ldb2O55203 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ldb2O55203 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ldb2O55203 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ldb2O55203 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ldb2O55203 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ldb2O55203 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ldb2O55203 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ldb2O55203 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ldb2O55203 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ldb2O55203 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ldb2O55203 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ldb2O55203 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Ldb2O55203 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ldb2O55203 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ldb2O55203 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ldb2O55203 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ldb2O55203 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ldb2O55203 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ldb2O55203 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ldb2O55203 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ldb2O55203 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ldb2O55203 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ldb2O55203 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ldb2O55203 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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Ldb2O55203 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ldb2O55203 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Ldb2O55203 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ldb2O55203 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ldb2O55203 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ldb2O55203 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ldb2O55203 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ldb2O55203 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Ldb2O55203 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Ldb2O55203 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Ldb2O55203 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ldb2O55203 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ldb2O55203 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ldb2O55203 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ldb2O55203 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ldb2O55203 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ldb2O55203 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ldb2O55203 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ldb2O55203 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ldb2O55203 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ldb2O55203 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Ldb2O55203 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ldb2O55203 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ldb2O55203 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ldb2O55203 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ldb2O55203 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ldb2O55203 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Ldb2O55203 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ldb2O55203 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ldb2O55203 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Ldb2O55203 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ldb2O55203 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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