Protein–RNA interactions for Protein: O54786

Dffa, DNA fragmentation factor subunit alpha, mousemouse

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffaO54786 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
DffaO54786 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
DffaO54786 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
DffaO54786 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
DffaO54786 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
DffaO54786 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
DffaO54786 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
DffaO54786 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
DffaO54786 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
DffaO54786 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
DffaO54786 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
DffaO54786 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
DffaO54786 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
DffaO54786 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
DffaO54786 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
DffaO54786 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
DffaO54786 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
DffaO54786 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
DffaO54786 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
DffaO54786 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
DffaO54786 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
DffaO54786 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
DffaO54786 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
DffaO54786 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
DffaO54786 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
DffaO54786 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
DffaO54786 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
DffaO54786 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
DffaO54786 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
DffaO54786 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
DffaO54786 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
DffaO54786 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
DffaO54786 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
DffaO54786 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
DffaO54786 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
DffaO54786 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
DffaO54786 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
DffaO54786 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
DffaO54786 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
DffaO54786 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
DffaO54786 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
DffaO54786 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
DffaO54786 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
DffaO54786 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
DffaO54786 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
DffaO54786 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
DffaO54786 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
DffaO54786 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
DffaO54786 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
DffaO54786 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
DffaO54786 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
DffaO54786 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
DffaO54786 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
DffaO54786 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
DffaO54786 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
DffaO54786 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
DffaO54786 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
DffaO54786 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
DffaO54786 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
DffaO54786 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
DffaO54786 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
DffaO54786 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
DffaO54786 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
DffaO54786 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
DffaO54786 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
DffaO54786 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
DffaO54786 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
DffaO54786 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
DffaO54786 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
DffaO54786 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
DffaO54786 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
DffaO54786 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
DffaO54786 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
DffaO54786 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
DffaO54786 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
DffaO54786 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
DffaO54786 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
DffaO54786 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
DffaO54786 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
DffaO54786 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
DffaO54786 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
DffaO54786 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
DffaO54786 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
DffaO54786 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
DffaO54786 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
DffaO54786 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
DffaO54786 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
DffaO54786 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
DffaO54786 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
DffaO54786 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
DffaO54786 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
DffaO54786 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
DffaO54786 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
DffaO54786 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
DffaO54786 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
DffaO54786 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
DffaO54786 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
DffaO54786 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
DffaO54786 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
DffaO54786 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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