Protein–RNA interactions for Protein: O35638

Stag2, Cohesin subunit SA-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stag2O35638 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Stag2O35638 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Stag2O35638 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Stag2O35638 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Stag2O35638 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Stag2O35638 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Stag2O35638 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Stag2O35638 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Stag2O35638 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Stag2O35638 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Stag2O35638 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Stag2O35638 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Stag2O35638 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Stag2O35638 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Stag2O35638 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Stag2O35638 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Stag2O35638 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Stag2O35638 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Stag2O35638 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Stag2O35638 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Stag2O35638 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Stag2O35638 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Stag2O35638 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Stag2O35638 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Stag2O35638 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Stag2O35638 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Stag2O35638 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Stag2O35638 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Stag2O35638 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Stag2O35638 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Stag2O35638 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Stag2O35638 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Stag2O35638 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Stag2O35638 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Stag2O35638 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Stag2O35638 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Stag2O35638 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Stag2O35638 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Stag2O35638 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Stag2O35638 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Stag2O35638 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Stag2O35638 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Stag2O35638 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Stag2O35638 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Stag2O35638 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Stag2O35638 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Stag2O35638 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Stag2O35638 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Stag2O35638 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Stag2O35638 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Stag2O35638 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Stag2O35638 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Stag2O35638 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Stag2O35638 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Stag2O35638 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Stag2O35638 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Stag2O35638 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Stag2O35638 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Stag2O35638 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Stag2O35638 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Stag2O35638 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Stag2O35638 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Stag2O35638 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Stag2O35638 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Stag2O35638 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Stag2O35638 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Stag2O35638 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Stag2O35638 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Stag2O35638 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Stag2O35638 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Stag2O35638 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Stag2O35638 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Stag2O35638 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Stag2O35638 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Stag2O35638 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Stag2O35638 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Stag2O35638 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Stag2O35638 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Stag2O35638 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Stag2O35638 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Stag2O35638 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Stag2O35638 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Stag2O35638 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Stag2O35638 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Stag2O35638 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Stag2O35638 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Stag2O35638 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Stag2O35638 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Stag2O35638 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Stag2O35638 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Stag2O35638 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Stag2O35638 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Stag2O35638 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Stag2O35638 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Stag2O35638 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Stag2O35638 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Stag2O35638 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Stag2O35638 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Stag2O35638 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Stag2O35638 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms