Protein–RNA interactions for Protein: O08585

Clta, Clathrin light chain A, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltaO08585 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CltaO08585 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CltaO08585 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CltaO08585 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CltaO08585 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CltaO08585 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CltaO08585 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CltaO08585 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CltaO08585 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CltaO08585 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CltaO08585 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CltaO08585 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CltaO08585 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CltaO08585 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CltaO08585 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CltaO08585 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CltaO08585 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CltaO08585 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CltaO08585 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CltaO08585 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CltaO08585 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CltaO08585 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CltaO08585 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CltaO08585 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CltaO08585 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CltaO08585 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CltaO08585 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CltaO08585 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CltaO08585 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CltaO08585 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
CltaO08585 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CltaO08585 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CltaO08585 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CltaO08585 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CltaO08585 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CltaO08585 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CltaO08585 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CltaO08585 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CltaO08585 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CltaO08585 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CltaO08585 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CltaO08585 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CltaO08585 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CltaO08585 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CltaO08585 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CltaO08585 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CltaO08585 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CltaO08585 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CltaO08585 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CltaO08585 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CltaO08585 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CltaO08585 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CltaO08585 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CltaO08585 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CltaO08585 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CltaO08585 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CltaO08585 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CltaO08585 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CltaO08585 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CltaO08585 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CltaO08585 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CltaO08585 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CltaO08585 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CltaO08585 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CltaO08585 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CltaO08585 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CltaO08585 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CltaO08585 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CltaO08585 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CltaO08585 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CltaO08585 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CltaO08585 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CltaO08585 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CltaO08585 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CltaO08585 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
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CltaO08585 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CltaO08585 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CltaO08585 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CltaO08585 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CltaO08585 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CltaO08585 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CltaO08585 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CltaO08585 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CltaO08585 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CltaO08585 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CltaO08585 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CltaO08585 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CltaO08585 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CltaO08585 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CltaO08585 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CltaO08585 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CltaO08585 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CltaO08585 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CltaO08585 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CltaO08585 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CltaO08585 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CltaO08585 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CltaO08585 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CltaO08585 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms