Protein–RNA interactions for Protein: M0QWN7

Usp35, Ubiquitin-specific peptidase 35, mousemouse

Predictions only

Length 1,009 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp35M0QWN7 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Usp35M0QWN7 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp35M0QWN7 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp35M0QWN7 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp35M0QWN7 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp35M0QWN7 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp35M0QWN7 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp35M0QWN7 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp35M0QWN7 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp35M0QWN7 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp35M0QWN7 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp35M0QWN7 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp35M0QWN7 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp35M0QWN7 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp35M0QWN7 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp35M0QWN7 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp35M0QWN7 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp35M0QWN7 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp35M0QWN7 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp35M0QWN7 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp35M0QWN7 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp35M0QWN7 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp35M0QWN7 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp35M0QWN7 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp35M0QWN7 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp35M0QWN7 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp35M0QWN7 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp35M0QWN7 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp35M0QWN7 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp35M0QWN7 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp35M0QWN7 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp35M0QWN7 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp35M0QWN7 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp35M0QWN7 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp35M0QWN7 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp35M0QWN7 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp35M0QWN7 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp35M0QWN7 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp35M0QWN7 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp35M0QWN7 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp35M0QWN7 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp35M0QWN7 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp35M0QWN7 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp35M0QWN7 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp35M0QWN7 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp35M0QWN7 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp35M0QWN7 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp35M0QWN7 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp35M0QWN7 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp35M0QWN7 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp35M0QWN7 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp35M0QWN7 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp35M0QWN7 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp35M0QWN7 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp35M0QWN7 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp35M0QWN7 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp35M0QWN7 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp35M0QWN7 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp35M0QWN7 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp35M0QWN7 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp35M0QWN7 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp35M0QWN7 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp35M0QWN7 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp35M0QWN7 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp35M0QWN7 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp35M0QWN7 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp35M0QWN7 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp35M0QWN7 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp35M0QWN7 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp35M0QWN7 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp35M0QWN7 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp35M0QWN7 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp35M0QWN7 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp35M0QWN7 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp35M0QWN7 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp35M0QWN7 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp35M0QWN7 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp35M0QWN7 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp35M0QWN7 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp35M0QWN7 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp35M0QWN7 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp35M0QWN7 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp35M0QWN7 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp35M0QWN7 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp35M0QWN7 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp35M0QWN7 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp35M0QWN7 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp35M0QWN7 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp35M0QWN7 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp35M0QWN7 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp35M0QWN7 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp35M0QWN7 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp35M0QWN7 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp35M0QWN7 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp35M0QWN7 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp35M0QWN7 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp35M0QWN7 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp35M0QWN7 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp35M0QWN7 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp35M0QWN7 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms