Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ04

Gm21887, Predicted gene, 21887, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21887J3QQ04 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Klra17-202ENSMUST00000122219 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Gm15866-202ENSMUST00000152116 914 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 1700025F22Rik-202ENSMUST00000180678 658 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Snhg14-202ENSMUST00000185693 734 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Gm29513-201ENSMUST00000185741 202 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Gm8384-201ENSMUST00000190905 704 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Gm36974-201ENSMUST00000194200 1071 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Gm9729-201ENSMUST00000196364 265 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 4930402F11Rik-201ENSMUST00000207348 1000 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 4933402C06Rik-203ENSMUST00000207559 1227 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 AL929285.1-201ENSMUST00000215522 229 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Gm17980-201ENSMUST00000217977 2349 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 AC155644.1-201ENSMUST00000218527 890 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 AC164597.2-201ENSMUST00000226738 603 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 CT030652.1-201ENSMUST00000227377 1235 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 AC136376.1-201ENSMUST00000228496 950 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Ssxb2-201ENSMUST00000023931 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Mitd1-201ENSMUST00000027257 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Olfr493-201ENSMUST00000080106 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Gm43258-201ENSMUST00000200312 1950 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Rfesd-201ENSMUST00000050997 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Hsf3-201ENSMUST00000059003 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Gm37245-201ENSMUST00000195137 2713 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Gm10093-201ENSMUST00000079363 1977 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Cntrob-201ENSMUST00000092973 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Psg20-201ENSMUST00000076677 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Gm12295-201ENSMUST00000128453 3189 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Gm21887J3QQ04 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms