Protein–RNA interactions for Protein: J3QP87

Gm2035, Predicted pseudogene 2035, mousemouse

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Length 144 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2035J3QP87 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm2035J3QP87 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm2035J3QP87 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm2035J3QP87 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm2035J3QP87 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm2035J3QP87 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm2035J3QP87 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm2035J3QP87 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm2035J3QP87 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm2035J3QP87 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm2035J3QP87 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm2035J3QP87 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm2035J3QP87 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm2035J3QP87 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm2035J3QP87 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm2035J3QP87 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm2035J3QP87 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm2035J3QP87 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm2035J3QP87 mt-Rnr1-201ENSMUST00000082388 955 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm2035J3QP87 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm2035J3QP87 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm2035J3QP87 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm2035J3QP87 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm2035J3QP87 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm2035J3QP87 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm2035J3QP87 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm2035J3QP87 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm2035J3QP87 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm2035J3QP87 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm2035J3QP87 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm2035J3QP87 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm2035J3QP87 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm2035J3QP87 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm2035J3QP87 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm2035J3QP87 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm2035J3QP87 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm2035J3QP87 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm2035J3QP87 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm2035J3QP87 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm2035J3QP87 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm2035J3QP87 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm2035J3QP87 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm2035J3QP87 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm2035J3QP87 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm2035J3QP87 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm2035J3QP87 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm2035J3QP87 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm2035J3QP87 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm2035J3QP87 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm2035J3QP87 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm2035J3QP87 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm2035J3QP87 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm2035J3QP87 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm2035J3QP87 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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Gm2035J3QP87 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm2035J3QP87 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm2035J3QP87 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm2035J3QP87 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm2035J3QP87 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm2035J3QP87 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm2035J3QP87 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm2035J3QP87 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm2035J3QP87 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm2035J3QP87 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm2035J3QP87 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm2035J3QP87 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm2035J3QP87 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm2035J3QP87 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm2035J3QP87 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Gm2035J3QP87 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.39
Gm2035J3QP87 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Gm2035J3QP87 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
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Gm2035J3QP87 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm2035J3QP87 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm2035J3QP87 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm2035J3QP87 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm2035J3QP87 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm2035J3QP87 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm2035J3QP87 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm2035J3QP87 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm2035J3QP87 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm2035J3QP87 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm2035J3QP87 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm2035J3QP87 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm2035J3QP87 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm2035J3QP87 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm2035J3QP87 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm2035J3QP87 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm2035J3QP87 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm2035J3QP87 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm2035J3QP87 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm2035J3QP87 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm2035J3QP87 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm2035J3QP87 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm2035J3QP87 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
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