Protein–RNA interactions for Protein: J3QMS7

Gm11236, Predicted gene 11236, mousemouse

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Length 360 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm11236J3QMS7 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm11236J3QMS7 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm11236J3QMS7 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm11236J3QMS7 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm11236J3QMS7 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm11236J3QMS7 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm11236J3QMS7 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm11236J3QMS7 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm11236J3QMS7 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm11236J3QMS7 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm11236J3QMS7 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm11236J3QMS7 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm11236J3QMS7 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm11236J3QMS7 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm11236J3QMS7 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm11236J3QMS7 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm11236J3QMS7 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm11236J3QMS7 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm11236J3QMS7 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm11236J3QMS7 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm11236J3QMS7 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm11236J3QMS7 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm11236J3QMS7 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm11236J3QMS7 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm11236J3QMS7 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm11236J3QMS7 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm11236J3QMS7 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm11236J3QMS7 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm11236J3QMS7 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm11236J3QMS7 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm11236J3QMS7 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm11236J3QMS7 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm11236J3QMS7 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm11236J3QMS7 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm11236J3QMS7 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm11236J3QMS7 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm11236J3QMS7 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm11236J3QMS7 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm11236J3QMS7 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm11236J3QMS7 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm11236J3QMS7 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm11236J3QMS7 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm11236J3QMS7 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm11236J3QMS7 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm11236J3QMS7 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm11236J3QMS7 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm11236J3QMS7 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm11236J3QMS7 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm11236J3QMS7 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm11236J3QMS7 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm11236J3QMS7 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm11236J3QMS7 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm11236J3QMS7 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm11236J3QMS7 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm11236J3QMS7 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm11236J3QMS7 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm11236J3QMS7 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm11236J3QMS7 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm11236J3QMS7 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm11236J3QMS7 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm11236J3QMS7 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm11236J3QMS7 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm11236J3QMS7 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm11236J3QMS7 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm11236J3QMS7 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm11236J3QMS7 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm11236J3QMS7 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm11236J3QMS7 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm11236J3QMS7 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm11236J3QMS7 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm11236J3QMS7 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm11236J3QMS7 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm11236J3QMS7 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm11236J3QMS7 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm11236J3QMS7 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm11236J3QMS7 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm11236J3QMS7 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm11236J3QMS7 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm11236J3QMS7 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm11236J3QMS7 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm11236J3QMS7 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm11236J3QMS7 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm11236J3QMS7 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm11236J3QMS7 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm11236J3QMS7 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm11236J3QMS7 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm11236J3QMS7 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm11236J3QMS7 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm11236J3QMS7 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm11236J3QMS7 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm11236J3QMS7 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm11236J3QMS7 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm11236J3QMS7 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm11236J3QMS7 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm11236J3QMS7 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm11236J3QMS7 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm11236J3QMS7 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm11236J3QMS7 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm11236J3QMS7 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm11236J3QMS7 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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