Protein–RNA interactions for Protein: J3QM67

Gm20825, Predicted gene, 20825, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20825J3QM67 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm20825J3QM67 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm20825J3QM67 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm20825J3QM67 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm20825J3QM67 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm20825J3QM67 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm20825J3QM67 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm20825J3QM67 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm20825J3QM67 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm20825J3QM67 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm20825J3QM67 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm20825J3QM67 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm20825J3QM67 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Gm20825J3QM67 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Gm20825J3QM67 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Gm20825J3QM67 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Gm20825J3QM67 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Gm20825J3QM67 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Gm20825J3QM67 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Gm20825J3QM67 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Gm20825J3QM67 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm20825J3QM67 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm20825J3QM67 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm20825J3QM67 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm20825J3QM67 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm20825J3QM67 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
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Gm20825J3QM67 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm20825J3QM67 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm20825J3QM67 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm20825J3QM67 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm20825J3QM67 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm20825J3QM67 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
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Gm20825J3QM67 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm20825J3QM67 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm20825J3QM67 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm20825J3QM67 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm20825J3QM67 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm20825J3QM67 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
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Gm20825J3QM67 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm20825J3QM67 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm20825J3QM67 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm20825J3QM67 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
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Gm20825J3QM67 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
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Gm20825J3QM67 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
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Gm20825J3QM67 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm20825J3QM67 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm20825J3QM67 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm20825J3QM67 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
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Gm20825J3QM67 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm20825J3QM67 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm20825J3QM67 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
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Gm20825J3QM67 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm20825J3QM67 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm20825J3QM67 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
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Gm20825J3QM67 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
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Gm20825J3QM67 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
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Gm20825J3QM67 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm20825J3QM67 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm20825J3QM67 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm20825J3QM67 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm20825J3QM67 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm20825J3QM67 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm20825J3QM67 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm20825J3QM67 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm20825J3QM67 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm20825J3QM67 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm20825J3QM67 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm20825J3QM67 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm20825J3QM67 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm20825J3QM67 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm20825J3QM67 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Gm20825J3QM67 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm20825J3QM67 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm20825J3QM67 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm20825J3QM67 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm20825J3QM67 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm20825J3QM67 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms