Protein–RNA interactions for Protein: J3QK46

Tmem200c, Transmembrane protein 200C, mousemouse

Predictions only

Length 637 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem200cJ3QK46 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmem200cJ3QK46 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmem200cJ3QK46 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmem200cJ3QK46 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmem200cJ3QK46 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmem200cJ3QK46 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmem200cJ3QK46 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmem200cJ3QK46 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmem200cJ3QK46 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmem200cJ3QK46 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmem200cJ3QK46 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmem200cJ3QK46 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmem200cJ3QK46 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmem200cJ3QK46 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmem200cJ3QK46 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmem200cJ3QK46 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmem200cJ3QK46 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmem200cJ3QK46 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmem200cJ3QK46 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmem200cJ3QK46 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmem200cJ3QK46 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmem200cJ3QK46 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmem200cJ3QK46 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmem200cJ3QK46 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmem200cJ3QK46 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmem200cJ3QK46 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmem200cJ3QK46 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmem200cJ3QK46 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmem200cJ3QK46 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmem200cJ3QK46 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmem200cJ3QK46 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmem200cJ3QK46 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmem200cJ3QK46 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmem200cJ3QK46 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmem200cJ3QK46 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmem200cJ3QK46 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmem200cJ3QK46 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmem200cJ3QK46 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmem200cJ3QK46 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmem200cJ3QK46 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmem200cJ3QK46 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmem200cJ3QK46 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmem200cJ3QK46 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmem200cJ3QK46 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmem200cJ3QK46 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmem200cJ3QK46 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmem200cJ3QK46 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmem200cJ3QK46 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmem200cJ3QK46 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmem200cJ3QK46 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmem200cJ3QK46 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmem200cJ3QK46 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmem200cJ3QK46 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmem200cJ3QK46 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmem200cJ3QK46 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmem200cJ3QK46 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmem200cJ3QK46 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmem200cJ3QK46 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmem200cJ3QK46 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmem200cJ3QK46 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmem200cJ3QK46 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmem200cJ3QK46 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmem200cJ3QK46 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmem200cJ3QK46 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmem200cJ3QK46 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmem200cJ3QK46 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmem200cJ3QK46 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmem200cJ3QK46 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Tmem200cJ3QK46 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Tmem200cJ3QK46 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Tmem200cJ3QK46 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem200cJ3QK46 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem200cJ3QK46 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem200cJ3QK46 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem200cJ3QK46 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem200cJ3QK46 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem200cJ3QK46 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem200cJ3QK46 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem200cJ3QK46 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem200cJ3QK46 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem200cJ3QK46 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem200cJ3QK46 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem200cJ3QK46 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem200cJ3QK46 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem200cJ3QK46 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem200cJ3QK46 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem200cJ3QK46 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem200cJ3QK46 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem200cJ3QK46 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem200cJ3QK46 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem200cJ3QK46 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem200cJ3QK46 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem200cJ3QK46 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem200cJ3QK46 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem200cJ3QK46 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem200cJ3QK46 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem200cJ3QK46 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem200cJ3QK46 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem200cJ3QK46 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem200cJ3QK46 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69 ms