Protein–RNA interactions for Protein: J3KMU4

Gm21060, Predicted gene, 21060, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21060J3KMU4 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21060J3KMU4 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21060J3KMU4 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21060J3KMU4 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21060J3KMU4 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21060J3KMU4 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21060J3KMU4 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21060J3KMU4 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21060J3KMU4 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21060J3KMU4 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21060J3KMU4 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21060J3KMU4 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21060J3KMU4 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21060J3KMU4 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm21060J3KMU4 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm21060J3KMU4 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm21060J3KMU4 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm21060J3KMU4 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm21060J3KMU4 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm21060J3KMU4 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm21060J3KMU4 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm21060J3KMU4 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm21060J3KMU4 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm21060J3KMU4 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm21060J3KMU4 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm21060J3KMU4 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm21060J3KMU4 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm21060J3KMU4 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm21060J3KMU4 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm21060J3KMU4 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm21060J3KMU4 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm21060J3KMU4 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm21060J3KMU4 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm21060J3KMU4 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm21060J3KMU4 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm21060J3KMU4 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm21060J3KMU4 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm21060J3KMU4 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm21060J3KMU4 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm21060J3KMU4 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm21060J3KMU4 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm21060J3KMU4 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm21060J3KMU4 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm21060J3KMU4 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm21060J3KMU4 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm21060J3KMU4 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm21060J3KMU4 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm21060J3KMU4 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm21060J3KMU4 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm21060J3KMU4 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm21060J3KMU4 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm21060J3KMU4 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm21060J3KMU4 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm21060J3KMU4 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm21060J3KMU4 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm21060J3KMU4 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm21060J3KMU4 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm21060J3KMU4 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm21060J3KMU4 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21060J3KMU4 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21060J3KMU4 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21060J3KMU4 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21060J3KMU4 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21060J3KMU4 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21060J3KMU4 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21060J3KMU4 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21060J3KMU4 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21060J3KMU4 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21060J3KMU4 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21060J3KMU4 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21060J3KMU4 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21060J3KMU4 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21060J3KMU4 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21060J3KMU4 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21060J3KMU4 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21060J3KMU4 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21060J3KMU4 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21060J3KMU4 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21060J3KMU4 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21060J3KMU4 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21060J3KMU4 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21060J3KMU4 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21060J3KMU4 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21060J3KMU4 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21060J3KMU4 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21060J3KMU4 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21060J3KMU4 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21060J3KMU4 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21060J3KMU4 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21060J3KMU4 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21060J3KMU4 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21060J3KMU4 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21060J3KMU4 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21060J3KMU4 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21060J3KMU4 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21060J3KMU4 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21060J3KMU4 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21060J3KMU4 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21060J3KMU4 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21060J3KMU4 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
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