Protein–RNA interactions for Protein: J3KMI7

Gm20828, MCG116667, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20828J3KMI7 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm20828J3KMI7 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm20828J3KMI7 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm20828J3KMI7 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm20828J3KMI7 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm20828J3KMI7 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm20828J3KMI7 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm20828J3KMI7 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm20828J3KMI7 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm20828J3KMI7 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm20828J3KMI7 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm20828J3KMI7 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm20828J3KMI7 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm20828J3KMI7 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm20828J3KMI7 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm20828J3KMI7 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm20828J3KMI7 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm20828J3KMI7 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm20828J3KMI7 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm20828J3KMI7 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Gm20828J3KMI7 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Gm20828J3KMI7 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Gm20828J3KMI7 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Gm20828J3KMI7 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm20828J3KMI7 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm20828J3KMI7 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm20828J3KMI7 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm20828J3KMI7 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm20828J3KMI7 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm20828J3KMI7 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm20828J3KMI7 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm20828J3KMI7 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm20828J3KMI7 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm20828J3KMI7 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm20828J3KMI7 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm20828J3KMI7 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm20828J3KMI7 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm20828J3KMI7 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm20828J3KMI7 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm20828J3KMI7 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm20828J3KMI7 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm20828J3KMI7 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm20828J3KMI7 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm20828J3KMI7 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm20828J3KMI7 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm20828J3KMI7 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm20828J3KMI7 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm20828J3KMI7 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm20828J3KMI7 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm20828J3KMI7 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm20828J3KMI7 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm20828J3KMI7 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm20828J3KMI7 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm20828J3KMI7 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm20828J3KMI7 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm20828J3KMI7 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm20828J3KMI7 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm20828J3KMI7 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm20828J3KMI7 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm20828J3KMI7 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm20828J3KMI7 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm20828J3KMI7 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm20828J3KMI7 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm20828J3KMI7 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm20828J3KMI7 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm20828J3KMI7 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm20828J3KMI7 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm20828J3KMI7 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm20828J3KMI7 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm20828J3KMI7 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm20828J3KMI7 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm20828J3KMI7 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm20828J3KMI7 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm20828J3KMI7 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm20828J3KMI7 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm20828J3KMI7 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm20828J3KMI7 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm20828J3KMI7 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm20828J3KMI7 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm20828J3KMI7 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm20828J3KMI7 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm20828J3KMI7 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm20828J3KMI7 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm20828J3KMI7 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm20828J3KMI7 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm20828J3KMI7 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm20828J3KMI7 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm20828J3KMI7 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm20828J3KMI7 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm20828J3KMI7 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm20828J3KMI7 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm20828J3KMI7 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm20828J3KMI7 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm20828J3KMI7 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm20828J3KMI7 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm20828J3KMI7 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm20828J3KMI7 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm20828J3KMI7 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm20828J3KMI7 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm20828J3KMI7 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms