Protein–RNA interactions for Protein: G3X9U3

Vmn1r58, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r58G3X9U3 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Vmn1r58G3X9U3 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.43
Vmn1r58G3X9U3 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC12.4□□□□□ -0.43
Vmn1r58G3X9U3 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Vmn1r58G3X9U3 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Vmn1r58G3X9U3 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Vmn1r58G3X9U3 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Vmn1r58G3X9U3 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Vmn1r58G3X9U3 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Vmn1r58G3X9U3 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Vmn1r58G3X9U3 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Vmn1r58G3X9U3 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Vmn1r58G3X9U3 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Vmn1r58G3X9U3 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Vmn1r58G3X9U3 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Vmn1r58G3X9U3 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Vmn1r58G3X9U3 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Vmn1r58G3X9U3 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Vmn1r58G3X9U3 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Vmn1r58G3X9U3 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Vmn1r58G3X9U3 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Vmn1r58G3X9U3 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Vmn1r58G3X9U3 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Vmn1r58G3X9U3 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Vmn1r58G3X9U3 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Vmn1r58G3X9U3 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Vmn1r58G3X9U3 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Vmn1r58G3X9U3 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Vmn1r58G3X9U3 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Vmn1r58G3X9U3 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Vmn1r58G3X9U3 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Vmn1r58G3X9U3 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Vmn1r58G3X9U3 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Vmn1r58G3X9U3 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Vmn1r58G3X9U3 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Vmn1r58G3X9U3 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Vmn1r58G3X9U3 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Vmn1r58G3X9U3 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Vmn1r58G3X9U3 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Vmn1r58G3X9U3 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Vmn1r58G3X9U3 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Vmn1r58G3X9U3 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Vmn1r58G3X9U3 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Vmn1r58G3X9U3 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Vmn1r58G3X9U3 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Vmn1r58G3X9U3 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Vmn1r58G3X9U3 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Vmn1r58G3X9U3 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Vmn1r58G3X9U3 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Vmn1r58G3X9U3 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Vmn1r58G3X9U3 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Vmn1r58G3X9U3 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Vmn1r58G3X9U3 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Vmn1r58G3X9U3 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Vmn1r58G3X9U3 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Vmn1r58G3X9U3 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Vmn1r58G3X9U3 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Vmn1r58G3X9U3 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Vmn1r58G3X9U3 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Vmn1r58G3X9U3 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Vmn1r58G3X9U3 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Vmn1r58G3X9U3 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Vmn1r58G3X9U3 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Vmn1r58G3X9U3 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Vmn1r58G3X9U3 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Vmn1r58G3X9U3 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Vmn1r58G3X9U3 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Vmn1r58G3X9U3 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Vmn1r58G3X9U3 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Vmn1r58G3X9U3 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Vmn1r58G3X9U3 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Vmn1r58G3X9U3 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Vmn1r58G3X9U3 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Vmn1r58G3X9U3 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Vmn1r58G3X9U3 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Vmn1r58G3X9U3 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Vmn1r58G3X9U3 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Vmn1r58G3X9U3 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Vmn1r58G3X9U3 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Vmn1r58G3X9U3 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Vmn1r58G3X9U3 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Vmn1r58G3X9U3 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Vmn1r58G3X9U3 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Vmn1r58G3X9U3 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Vmn1r58G3X9U3 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Vmn1r58G3X9U3 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Vmn1r58G3X9U3 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Vmn1r58G3X9U3 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Vmn1r58G3X9U3 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Vmn1r58G3X9U3 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Vmn1r58G3X9U3 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Vmn1r58G3X9U3 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Vmn1r58G3X9U3 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Vmn1r58G3X9U3 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Vmn1r58G3X9U3 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Vmn1r58G3X9U3 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Vmn1r58G3X9U3 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Vmn1r58G3X9U3 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Vmn1r58G3X9U3 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Vmn1r58G3X9U3 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms