Protein–RNA interactions for Protein: F8VQM8

Xntrpc, Xndc1-transient receptor potential cation channel, subfamily C, member 2 readthrough, mousemouse

Predictions only

Length 1,264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XntrpcF8VQM8 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
XntrpcF8VQM8 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
XntrpcF8VQM8 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
XntrpcF8VQM8 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
XntrpcF8VQM8 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
XntrpcF8VQM8 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
XntrpcF8VQM8 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
XntrpcF8VQM8 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
XntrpcF8VQM8 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
XntrpcF8VQM8 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
XntrpcF8VQM8 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
XntrpcF8VQM8 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
XntrpcF8VQM8 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
XntrpcF8VQM8 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
XntrpcF8VQM8 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
XntrpcF8VQM8 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
XntrpcF8VQM8 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
XntrpcF8VQM8 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
XntrpcF8VQM8 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
XntrpcF8VQM8 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
XntrpcF8VQM8 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
XntrpcF8VQM8 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
XntrpcF8VQM8 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
XntrpcF8VQM8 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
XntrpcF8VQM8 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
XntrpcF8VQM8 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
XntrpcF8VQM8 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
XntrpcF8VQM8 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
XntrpcF8VQM8 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
XntrpcF8VQM8 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
XntrpcF8VQM8 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
XntrpcF8VQM8 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
XntrpcF8VQM8 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
XntrpcF8VQM8 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
XntrpcF8VQM8 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
XntrpcF8VQM8 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
XntrpcF8VQM8 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
XntrpcF8VQM8 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
XntrpcF8VQM8 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
XntrpcF8VQM8 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
XntrpcF8VQM8 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
XntrpcF8VQM8 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
XntrpcF8VQM8 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
XntrpcF8VQM8 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
XntrpcF8VQM8 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
XntrpcF8VQM8 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
XntrpcF8VQM8 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
XntrpcF8VQM8 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
XntrpcF8VQM8 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
XntrpcF8VQM8 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
XntrpcF8VQM8 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
XntrpcF8VQM8 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
XntrpcF8VQM8 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
XntrpcF8VQM8 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
XntrpcF8VQM8 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
XntrpcF8VQM8 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
XntrpcF8VQM8 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
XntrpcF8VQM8 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
XntrpcF8VQM8 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
XntrpcF8VQM8 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
XntrpcF8VQM8 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
XntrpcF8VQM8 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
XntrpcF8VQM8 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
XntrpcF8VQM8 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
XntrpcF8VQM8 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
XntrpcF8VQM8 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
XntrpcF8VQM8 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
XntrpcF8VQM8 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
XntrpcF8VQM8 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
XntrpcF8VQM8 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
XntrpcF8VQM8 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
XntrpcF8VQM8 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
XntrpcF8VQM8 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
XntrpcF8VQM8 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
XntrpcF8VQM8 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
XntrpcF8VQM8 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
XntrpcF8VQM8 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
XntrpcF8VQM8 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
XntrpcF8VQM8 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
XntrpcF8VQM8 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
XntrpcF8VQM8 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
XntrpcF8VQM8 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
XntrpcF8VQM8 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
XntrpcF8VQM8 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
XntrpcF8VQM8 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
XntrpcF8VQM8 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
XntrpcF8VQM8 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
XntrpcF8VQM8 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
XntrpcF8VQM8 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
XntrpcF8VQM8 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
XntrpcF8VQM8 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
XntrpcF8VQM8 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
XntrpcF8VQM8 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
XntrpcF8VQM8 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
XntrpcF8VQM8 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
XntrpcF8VQM8 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
XntrpcF8VQM8 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
XntrpcF8VQM8 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
XntrpcF8VQM8 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
XntrpcF8VQM8 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61 ms