Protein–RNA interactions for Protein: F8VPN3

Gm5160, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5160F8VPN3 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm5160F8VPN3 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm5160F8VPN3 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm5160F8VPN3 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm5160F8VPN3 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm5160F8VPN3 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm5160F8VPN3 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm5160F8VPN3 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm5160F8VPN3 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm5160F8VPN3 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm5160F8VPN3 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm5160F8VPN3 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm5160F8VPN3 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm5160F8VPN3 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm5160F8VPN3 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm5160F8VPN3 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm5160F8VPN3 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm5160F8VPN3 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm5160F8VPN3 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm5160F8VPN3 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm5160F8VPN3 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm5160F8VPN3 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm5160F8VPN3 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm5160F8VPN3 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm5160F8VPN3 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm5160F8VPN3 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm5160F8VPN3 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm5160F8VPN3 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm5160F8VPN3 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm5160F8VPN3 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm5160F8VPN3 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm5160F8VPN3 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm5160F8VPN3 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm5160F8VPN3 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm5160F8VPN3 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm5160F8VPN3 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm5160F8VPN3 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm5160F8VPN3 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm5160F8VPN3 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm5160F8VPN3 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm5160F8VPN3 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm5160F8VPN3 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm5160F8VPN3 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm5160F8VPN3 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm5160F8VPN3 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm5160F8VPN3 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm5160F8VPN3 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm5160F8VPN3 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm5160F8VPN3 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm5160F8VPN3 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm5160F8VPN3 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm5160F8VPN3 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm5160F8VPN3 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm5160F8VPN3 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm5160F8VPN3 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm5160F8VPN3 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm5160F8VPN3 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm5160F8VPN3 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm5160F8VPN3 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm5160F8VPN3 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm5160F8VPN3 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm5160F8VPN3 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm5160F8VPN3 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm5160F8VPN3 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm5160F8VPN3 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm5160F8VPN3 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm5160F8VPN3 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm5160F8VPN3 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm5160F8VPN3 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm5160F8VPN3 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm5160F8VPN3 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm5160F8VPN3 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm5160F8VPN3 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm5160F8VPN3 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm5160F8VPN3 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm5160F8VPN3 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm5160F8VPN3 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm5160F8VPN3 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm5160F8VPN3 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm5160F8VPN3 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm5160F8VPN3 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm5160F8VPN3 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm5160F8VPN3 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm5160F8VPN3 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm5160F8VPN3 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm5160F8VPN3 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm5160F8VPN3 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm5160F8VPN3 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm5160F8VPN3 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm5160F8VPN3 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm5160F8VPN3 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm5160F8VPN3 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm5160F8VPN3 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm5160F8VPN3 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm5160F8VPN3 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm5160F8VPN3 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm5160F8VPN3 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm5160F8VPN3 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm5160F8VPN3 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm5160F8VPN3 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.5 ms