Protein–RNA interactions for Protein: F7CXU4

H2-M1, Histocompatibility 2, M region locus 1, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M1F7CXU4 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
H2-M1F7CXU4 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
H2-M1F7CXU4 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
H2-M1F7CXU4 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
H2-M1F7CXU4 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
H2-M1F7CXU4 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
H2-M1F7CXU4 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
H2-M1F7CXU4 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
H2-M1F7CXU4 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
H2-M1F7CXU4 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
H2-M1F7CXU4 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
H2-M1F7CXU4 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
H2-M1F7CXU4 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
H2-M1F7CXU4 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
H2-M1F7CXU4 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
H2-M1F7CXU4 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
H2-M1F7CXU4 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
H2-M1F7CXU4 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
H2-M1F7CXU4 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
H2-M1F7CXU4 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
H2-M1F7CXU4 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
H2-M1F7CXU4 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
H2-M1F7CXU4 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
H2-M1F7CXU4 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC12.56□□□□□ -0.4
H2-M1F7CXU4 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
H2-M1F7CXU4 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
H2-M1F7CXU4 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
H2-M1F7CXU4 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
H2-M1F7CXU4 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
H2-M1F7CXU4 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
H2-M1F7CXU4 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
H2-M1F7CXU4 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
H2-M1F7CXU4 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
H2-M1F7CXU4 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
H2-M1F7CXU4 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
H2-M1F7CXU4 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
H2-M1F7CXU4 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
H2-M1F7CXU4 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
H2-M1F7CXU4 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
H2-M1F7CXU4 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
H2-M1F7CXU4 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
H2-M1F7CXU4 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
H2-M1F7CXU4 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
H2-M1F7CXU4 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
H2-M1F7CXU4 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
H2-M1F7CXU4 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
H2-M1F7CXU4 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
H2-M1F7CXU4 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
H2-M1F7CXU4 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
H2-M1F7CXU4 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
H2-M1F7CXU4 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
H2-M1F7CXU4 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
H2-M1F7CXU4 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
H2-M1F7CXU4 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
H2-M1F7CXU4 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
H2-M1F7CXU4 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
H2-M1F7CXU4 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
H2-M1F7CXU4 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
H2-M1F7CXU4 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
H2-M1F7CXU4 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
H2-M1F7CXU4 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
H2-M1F7CXU4 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
H2-M1F7CXU4 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
H2-M1F7CXU4 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
H2-M1F7CXU4 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
H2-M1F7CXU4 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
H2-M1F7CXU4 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
H2-M1F7CXU4 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
H2-M1F7CXU4 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
H2-M1F7CXU4 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
H2-M1F7CXU4 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC12.55□□□□□ -0.4
H2-M1F7CXU4 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
H2-M1F7CXU4 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
H2-M1F7CXU4 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
H2-M1F7CXU4 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
H2-M1F7CXU4 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
H2-M1F7CXU4 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
H2-M1F7CXU4 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
H2-M1F7CXU4 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
H2-M1F7CXU4 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
H2-M1F7CXU4 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
H2-M1F7CXU4 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
H2-M1F7CXU4 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
H2-M1F7CXU4 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
H2-M1F7CXU4 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
H2-M1F7CXU4 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
H2-M1F7CXU4 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
H2-M1F7CXU4 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC12.54□□□□□ -0.4
H2-M1F7CXU4 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
H2-M1F7CXU4 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
H2-M1F7CXU4 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
H2-M1F7CXU4 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
H2-M1F7CXU4 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
H2-M1F7CXU4 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
H2-M1F7CXU4 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
H2-M1F7CXU4 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
H2-M1F7CXU4 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
H2-M1F7CXU4 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
H2-M1F7CXU4 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
H2-M1F7CXU4 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
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