Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN0

Gm28048, Predicted gene, 28048 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28048F7BCN0 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm28048F7BCN0 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm28048F7BCN0 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm28048F7BCN0 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm28048F7BCN0 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm28048F7BCN0 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm28048F7BCN0 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm28048F7BCN0 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm28048F7BCN0 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm28048F7BCN0 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm28048F7BCN0 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm28048F7BCN0 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm28048F7BCN0 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm28048F7BCN0 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm28048F7BCN0 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm28048F7BCN0 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm28048F7BCN0 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm28048F7BCN0 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm28048F7BCN0 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm28048F7BCN0 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm28048F7BCN0 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm28048F7BCN0 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm28048F7BCN0 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm28048F7BCN0 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm28048F7BCN0 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm28048F7BCN0 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm28048F7BCN0 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm28048F7BCN0 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm28048F7BCN0 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm28048F7BCN0 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm28048F7BCN0 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm28048F7BCN0 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm28048F7BCN0 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm28048F7BCN0 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm28048F7BCN0 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm28048F7BCN0 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm28048F7BCN0 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm28048F7BCN0 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm28048F7BCN0 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm28048F7BCN0 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm28048F7BCN0 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm28048F7BCN0 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm28048F7BCN0 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm28048F7BCN0 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm28048F7BCN0 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm28048F7BCN0 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm28048F7BCN0 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm28048F7BCN0 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm28048F7BCN0 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm28048F7BCN0 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm28048F7BCN0 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm28048F7BCN0 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm28048F7BCN0 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm28048F7BCN0 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm28048F7BCN0 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm28048F7BCN0 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm28048F7BCN0 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm28048F7BCN0 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm28048F7BCN0 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm28048F7BCN0 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm28048F7BCN0 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm28048F7BCN0 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm28048F7BCN0 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm28048F7BCN0 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm28048F7BCN0 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm28048F7BCN0 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm28048F7BCN0 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm28048F7BCN0 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm28048F7BCN0 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm28048F7BCN0 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm28048F7BCN0 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm28048F7BCN0 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm28048F7BCN0 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm28048F7BCN0 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm28048F7BCN0 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm28048F7BCN0 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm28048F7BCN0 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm28048F7BCN0 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm28048F7BCN0 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm28048F7BCN0 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm28048F7BCN0 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm28048F7BCN0 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm28048F7BCN0 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm28048F7BCN0 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm28048F7BCN0 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm28048F7BCN0 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm28048F7BCN0 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm28048F7BCN0 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm28048F7BCN0 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm28048F7BCN0 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm28048F7BCN0 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm28048F7BCN0 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm28048F7BCN0 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm28048F7BCN0 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm28048F7BCN0 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm28048F7BCN0 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm28048F7BCN0 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm28048F7BCN0 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm28048F7BCN0 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm28048F7BCN0 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.4 ms