Protein–RNA interactions for Protein: F6SW83

Gm10477, Predicted gene 10477, mousemouse

Predictions only

Length 55 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10477F6SW83 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm10477F6SW83 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm10477F6SW83 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm10477F6SW83 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm10477F6SW83 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm10477F6SW83 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm10477F6SW83 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm10477F6SW83 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm10477F6SW83 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm10477F6SW83 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm10477F6SW83 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm10477F6SW83 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm10477F6SW83 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm10477F6SW83 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm10477F6SW83 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm10477F6SW83 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm10477F6SW83 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm10477F6SW83 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm10477F6SW83 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm10477F6SW83 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm10477F6SW83 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm10477F6SW83 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm10477F6SW83 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm10477F6SW83 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm10477F6SW83 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm10477F6SW83 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm10477F6SW83 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm10477F6SW83 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm10477F6SW83 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm10477F6SW83 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm10477F6SW83 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm10477F6SW83 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm10477F6SW83 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm10477F6SW83 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm10477F6SW83 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm10477F6SW83 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm10477F6SW83 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm10477F6SW83 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm10477F6SW83 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm10477F6SW83 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm10477F6SW83 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm10477F6SW83 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm10477F6SW83 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm10477F6SW83 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm10477F6SW83 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm10477F6SW83 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm10477F6SW83 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm10477F6SW83 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm10477F6SW83 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm10477F6SW83 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm10477F6SW83 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm10477F6SW83 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm10477F6SW83 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm10477F6SW83 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm10477F6SW83 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm10477F6SW83 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm10477F6SW83 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm10477F6SW83 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm10477F6SW83 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm10477F6SW83 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm10477F6SW83 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm10477F6SW83 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm10477F6SW83 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm10477F6SW83 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm10477F6SW83 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm10477F6SW83 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm10477F6SW83 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm10477F6SW83 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm10477F6SW83 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm10477F6SW83 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm10477F6SW83 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm10477F6SW83 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm10477F6SW83 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm10477F6SW83 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm10477F6SW83 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm10477F6SW83 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm10477F6SW83 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm10477F6SW83 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm10477F6SW83 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm10477F6SW83 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm10477F6SW83 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm10477F6SW83 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm10477F6SW83 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm10477F6SW83 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm10477F6SW83 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm10477F6SW83 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm10477F6SW83 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm10477F6SW83 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm10477F6SW83 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm10477F6SW83 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm10477F6SW83 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm10477F6SW83 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm10477F6SW83 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm10477F6SW83 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm10477F6SW83 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm10477F6SW83 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm10477F6SW83 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm10477F6SW83 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm10477F6SW83 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm10477F6SW83 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.8 ms