Protein–RNA interactions for Protein: F6SEU4

Syngap1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, mousemouse

Predictions only

Length 1,340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngap1F6SEU4 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Syngap1F6SEU4 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Syngap1F6SEU4 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Syngap1F6SEU4 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Syngap1F6SEU4 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Syngap1F6SEU4 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Syngap1F6SEU4 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Syngap1F6SEU4 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Syngap1F6SEU4 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Syngap1F6SEU4 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Syngap1F6SEU4 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Syngap1F6SEU4 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Syngap1F6SEU4 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Syngap1F6SEU4 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Syngap1F6SEU4 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Syngap1F6SEU4 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Syngap1F6SEU4 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Syngap1F6SEU4 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Syngap1F6SEU4 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Syngap1F6SEU4 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Syngap1F6SEU4 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Syngap1F6SEU4 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Syngap1F6SEU4 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Syngap1F6SEU4 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Syngap1F6SEU4 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Syngap1F6SEU4 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Syngap1F6SEU4 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Syngap1F6SEU4 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Syngap1F6SEU4 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Syngap1F6SEU4 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Syngap1F6SEU4 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Syngap1F6SEU4 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Syngap1F6SEU4 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Syngap1F6SEU4 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Syngap1F6SEU4 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Syngap1F6SEU4 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Syngap1F6SEU4 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Syngap1F6SEU4 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Syngap1F6SEU4 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Syngap1F6SEU4 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Syngap1F6SEU4 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Syngap1F6SEU4 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Syngap1F6SEU4 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Syngap1F6SEU4 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Syngap1F6SEU4 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Syngap1F6SEU4 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Syngap1F6SEU4 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Syngap1F6SEU4 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Syngap1F6SEU4 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Syngap1F6SEU4 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Syngap1F6SEU4 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Syngap1F6SEU4 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Syngap1F6SEU4 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Syngap1F6SEU4 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Syngap1F6SEU4 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Syngap1F6SEU4 Snx29-202ENSMUST00000115814 1125 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Syngap1F6SEU4 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Syngap1F6SEU4 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Syngap1F6SEU4 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Syngap1F6SEU4 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Syngap1F6SEU4 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Syngap1F6SEU4 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Syngap1F6SEU4 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Syngap1F6SEU4 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Syngap1F6SEU4 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Syngap1F6SEU4 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Syngap1F6SEU4 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Syngap1F6SEU4 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Syngap1F6SEU4 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Syngap1F6SEU4 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Syngap1F6SEU4 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Syngap1F6SEU4 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Syngap1F6SEU4 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Syngap1F6SEU4 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Syngap1F6SEU4 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Syngap1F6SEU4 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Syngap1F6SEU4 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Syngap1F6SEU4 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Syngap1F6SEU4 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Syngap1F6SEU4 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Syngap1F6SEU4 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Syngap1F6SEU4 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Syngap1F6SEU4 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Syngap1F6SEU4 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Syngap1F6SEU4 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Syngap1F6SEU4 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Syngap1F6SEU4 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Syngap1F6SEU4 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Syngap1F6SEU4 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Syngap1F6SEU4 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Syngap1F6SEU4 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Syngap1F6SEU4 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Syngap1F6SEU4 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Syngap1F6SEU4 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Syngap1F6SEU4 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Syngap1F6SEU4 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Syngap1F6SEU4 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Syngap1F6SEU4 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Syngap1F6SEU4 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Syngap1F6SEU4 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms