Protein–RNA interactions for Protein: F6RGI3

Gm340, Predicted gene 340, mousemouse

Predictions only

Length 1,242 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm340F6RGI3 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm340F6RGI3 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm340F6RGI3 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm340F6RGI3 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm340F6RGI3 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm340F6RGI3 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm340F6RGI3 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm340F6RGI3 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm340F6RGI3 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm340F6RGI3 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm340F6RGI3 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm340F6RGI3 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm340F6RGI3 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm340F6RGI3 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm340F6RGI3 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm340F6RGI3 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm340F6RGI3 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm340F6RGI3 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm340F6RGI3 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm340F6RGI3 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm340F6RGI3 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm340F6RGI3 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm340F6RGI3 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm340F6RGI3 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm340F6RGI3 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm340F6RGI3 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm340F6RGI3 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm340F6RGI3 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm340F6RGI3 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm340F6RGI3 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm340F6RGI3 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm340F6RGI3 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm340F6RGI3 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm340F6RGI3 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm340F6RGI3 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm340F6RGI3 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm340F6RGI3 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm340F6RGI3 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm340F6RGI3 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm340F6RGI3 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm340F6RGI3 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm340F6RGI3 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm340F6RGI3 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm340F6RGI3 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm340F6RGI3 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm340F6RGI3 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm340F6RGI3 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm340F6RGI3 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm340F6RGI3 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm340F6RGI3 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm340F6RGI3 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm340F6RGI3 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm340F6RGI3 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm340F6RGI3 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm340F6RGI3 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm340F6RGI3 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm340F6RGI3 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm340F6RGI3 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm340F6RGI3 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm340F6RGI3 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm340F6RGI3 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm340F6RGI3 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm340F6RGI3 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm340F6RGI3 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm340F6RGI3 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm340F6RGI3 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm340F6RGI3 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm340F6RGI3 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm340F6RGI3 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm340F6RGI3 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm340F6RGI3 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm340F6RGI3 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm340F6RGI3 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm340F6RGI3 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm340F6RGI3 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm340F6RGI3 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm340F6RGI3 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm340F6RGI3 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm340F6RGI3 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm340F6RGI3 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm340F6RGI3 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm340F6RGI3 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm340F6RGI3 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm340F6RGI3 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm340F6RGI3 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm340F6RGI3 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm340F6RGI3 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm340F6RGI3 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm340F6RGI3 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm340F6RGI3 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm340F6RGI3 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm340F6RGI3 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm340F6RGI3 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm340F6RGI3 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm340F6RGI3 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm340F6RGI3 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm340F6RGI3 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm340F6RGI3 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm340F6RGI3 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm340F6RGI3 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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