Protein–RNA interactions for Protein: E9QA62

Lmod3, Leiomodin-3, mousemouse

Predictions only

Length 571 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod3E9QA62 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Lmod3E9QA62 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lmod3E9QA62 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lmod3E9QA62 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lmod3E9QA62 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lmod3E9QA62 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lmod3E9QA62 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lmod3E9QA62 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lmod3E9QA62 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lmod3E9QA62 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lmod3E9QA62 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lmod3E9QA62 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lmod3E9QA62 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lmod3E9QA62 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lmod3E9QA62 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lmod3E9QA62 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lmod3E9QA62 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lmod3E9QA62 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lmod3E9QA62 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lmod3E9QA62 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lmod3E9QA62 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Lmod3E9QA62 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Lmod3E9QA62 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lmod3E9QA62 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lmod3E9QA62 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lmod3E9QA62 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lmod3E9QA62 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Lmod3E9QA62 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lmod3E9QA62 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Lmod3E9QA62 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lmod3E9QA62 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lmod3E9QA62 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lmod3E9QA62 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lmod3E9QA62 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lmod3E9QA62 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lmod3E9QA62 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lmod3E9QA62 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lmod3E9QA62 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lmod3E9QA62 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lmod3E9QA62 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lmod3E9QA62 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lmod3E9QA62 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lmod3E9QA62 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lmod3E9QA62 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lmod3E9QA62 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lmod3E9QA62 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lmod3E9QA62 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lmod3E9QA62 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Lmod3E9QA62 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lmod3E9QA62 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lmod3E9QA62 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lmod3E9QA62 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lmod3E9QA62 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lmod3E9QA62 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lmod3E9QA62 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lmod3E9QA62 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lmod3E9QA62 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Lmod3E9QA62 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lmod3E9QA62 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lmod3E9QA62 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lmod3E9QA62 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lmod3E9QA62 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lmod3E9QA62 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lmod3E9QA62 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lmod3E9QA62 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lmod3E9QA62 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lmod3E9QA62 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Lmod3E9QA62 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lmod3E9QA62 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lmod3E9QA62 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lmod3E9QA62 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lmod3E9QA62 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lmod3E9QA62 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lmod3E9QA62 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lmod3E9QA62 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lmod3E9QA62 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Lmod3E9QA62 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Lmod3E9QA62 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lmod3E9QA62 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lmod3E9QA62 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lmod3E9QA62 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lmod3E9QA62 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lmod3E9QA62 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lmod3E9QA62 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lmod3E9QA62 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lmod3E9QA62 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Lmod3E9QA62 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Lmod3E9QA62 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lmod3E9QA62 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lmod3E9QA62 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lmod3E9QA62 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lmod3E9QA62 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Lmod3E9QA62 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lmod3E9QA62 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lmod3E9QA62 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lmod3E9QA62 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lmod3E9QA62 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lmod3E9QA62 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lmod3E9QA62 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lmod3E9QA62 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms