Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9Q2

R3hdm1, R3H domain-containing 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,135 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3hdm1E9Q9Q2 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
R3hdm1E9Q9Q2 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
R3hdm1E9Q9Q2 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
R3hdm1E9Q9Q2 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
R3hdm1E9Q9Q2 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
R3hdm1E9Q9Q2 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
R3hdm1E9Q9Q2 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
R3hdm1E9Q9Q2 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
R3hdm1E9Q9Q2 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
R3hdm1E9Q9Q2 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
R3hdm1E9Q9Q2 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
R3hdm1E9Q9Q2 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
R3hdm1E9Q9Q2 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
R3hdm1E9Q9Q2 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
R3hdm1E9Q9Q2 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
R3hdm1E9Q9Q2 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
R3hdm1E9Q9Q2 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
R3hdm1E9Q9Q2 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
R3hdm1E9Q9Q2 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
R3hdm1E9Q9Q2 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
R3hdm1E9Q9Q2 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
R3hdm1E9Q9Q2 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
R3hdm1E9Q9Q2 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
R3hdm1E9Q9Q2 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
R3hdm1E9Q9Q2 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
R3hdm1E9Q9Q2 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
R3hdm1E9Q9Q2 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
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R3hdm1E9Q9Q2 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
R3hdm1E9Q9Q2 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
R3hdm1E9Q9Q2 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
R3hdm1E9Q9Q2 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
R3hdm1E9Q9Q2 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
R3hdm1E9Q9Q2 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
R3hdm1E9Q9Q2 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
R3hdm1E9Q9Q2 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
R3hdm1E9Q9Q2 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
R3hdm1E9Q9Q2 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
R3hdm1E9Q9Q2 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
R3hdm1E9Q9Q2 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
R3hdm1E9Q9Q2 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
R3hdm1E9Q9Q2 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
R3hdm1E9Q9Q2 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
R3hdm1E9Q9Q2 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
R3hdm1E9Q9Q2 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
R3hdm1E9Q9Q2 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
R3hdm1E9Q9Q2 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
R3hdm1E9Q9Q2 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
R3hdm1E9Q9Q2 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
R3hdm1E9Q9Q2 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
R3hdm1E9Q9Q2 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
R3hdm1E9Q9Q2 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
R3hdm1E9Q9Q2 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
R3hdm1E9Q9Q2 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
R3hdm1E9Q9Q2 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
R3hdm1E9Q9Q2 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
R3hdm1E9Q9Q2 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
R3hdm1E9Q9Q2 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
R3hdm1E9Q9Q2 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
R3hdm1E9Q9Q2 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
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R3hdm1E9Q9Q2 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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R3hdm1E9Q9Q2 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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R3hdm1E9Q9Q2 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
R3hdm1E9Q9Q2 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
R3hdm1E9Q9Q2 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
R3hdm1E9Q9Q2 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
R3hdm1E9Q9Q2 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
R3hdm1E9Q9Q2 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
R3hdm1E9Q9Q2 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
R3hdm1E9Q9Q2 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
R3hdm1E9Q9Q2 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
R3hdm1E9Q9Q2 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
R3hdm1E9Q9Q2 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
R3hdm1E9Q9Q2 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
R3hdm1E9Q9Q2 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
R3hdm1E9Q9Q2 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
R3hdm1E9Q9Q2 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
R3hdm1E9Q9Q2 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
R3hdm1E9Q9Q2 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
R3hdm1E9Q9Q2 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
R3hdm1E9Q9Q2 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
R3hdm1E9Q9Q2 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
R3hdm1E9Q9Q2 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
R3hdm1E9Q9Q2 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
R3hdm1E9Q9Q2 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
R3hdm1E9Q9Q2 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
R3hdm1E9Q9Q2 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
R3hdm1E9Q9Q2 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
R3hdm1E9Q9Q2 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
R3hdm1E9Q9Q2 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
R3hdm1E9Q9Q2 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
R3hdm1E9Q9Q2 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
R3hdm1E9Q9Q2 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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