Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0F0

Krt78, Keratin 78, mousemouse

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt78E9Q0F0 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krt78E9Q0F0 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krt78E9Q0F0 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krt78E9Q0F0 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krt78E9Q0F0 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krt78E9Q0F0 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krt78E9Q0F0 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krt78E9Q0F0 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krt78E9Q0F0 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krt78E9Q0F0 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krt78E9Q0F0 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krt78E9Q0F0 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krt78E9Q0F0 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krt78E9Q0F0 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krt78E9Q0F0 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krt78E9Q0F0 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krt78E9Q0F0 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krt78E9Q0F0 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Krt78E9Q0F0 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krt78E9Q0F0 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krt78E9Q0F0 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krt78E9Q0F0 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krt78E9Q0F0 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krt78E9Q0F0 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krt78E9Q0F0 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krt78E9Q0F0 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krt78E9Q0F0 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Krt78E9Q0F0 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krt78E9Q0F0 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Krt78E9Q0F0 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krt78E9Q0F0 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krt78E9Q0F0 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krt78E9Q0F0 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krt78E9Q0F0 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krt78E9Q0F0 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krt78E9Q0F0 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krt78E9Q0F0 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krt78E9Q0F0 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krt78E9Q0F0 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krt78E9Q0F0 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krt78E9Q0F0 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krt78E9Q0F0 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krt78E9Q0F0 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krt78E9Q0F0 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt78E9Q0F0 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt78E9Q0F0 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt78E9Q0F0 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt78E9Q0F0 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt78E9Q0F0 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt78E9Q0F0 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt78E9Q0F0 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt78E9Q0F0 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt78E9Q0F0 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt78E9Q0F0 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt78E9Q0F0 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt78E9Q0F0 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt78E9Q0F0 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt78E9Q0F0 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt78E9Q0F0 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt78E9Q0F0 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt78E9Q0F0 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt78E9Q0F0 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt78E9Q0F0 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt78E9Q0F0 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt78E9Q0F0 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt78E9Q0F0 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt78E9Q0F0 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt78E9Q0F0 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt78E9Q0F0 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt78E9Q0F0 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt78E9Q0F0 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt78E9Q0F0 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt78E9Q0F0 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt78E9Q0F0 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt78E9Q0F0 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt78E9Q0F0 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt78E9Q0F0 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt78E9Q0F0 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt78E9Q0F0 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt78E9Q0F0 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt78E9Q0F0 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt78E9Q0F0 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt78E9Q0F0 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt78E9Q0F0 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt78E9Q0F0 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt78E9Q0F0 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt78E9Q0F0 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt78E9Q0F0 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt78E9Q0F0 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt78E9Q0F0 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt78E9Q0F0 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt78E9Q0F0 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt78E9Q0F0 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt78E9Q0F0 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt78E9Q0F0 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt78E9Q0F0 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt78E9Q0F0 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt78E9Q0F0 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt78E9Q0F0 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt78E9Q0F0 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms