Protein–RNA interactions for Protein: E9Q043

Fndc1, Fibronectin type III domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc1E9Q043 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Fndc1E9Q043 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Fndc1E9Q043 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Fndc1E9Q043 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Fndc1E9Q043 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Fndc1E9Q043 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Fndc1E9Q043 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Fndc1E9Q043 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Fndc1E9Q043 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Fndc1E9Q043 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Fndc1E9Q043 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Fndc1E9Q043 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Fndc1E9Q043 Rpl15-204ENSMUST00000112598 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Fndc1E9Q043 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Fndc1E9Q043 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Fndc1E9Q043 AC127270.1-201ENSMUST00000221441 491 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Fndc1E9Q043 AC136986.1-201ENSMUST00000222829 380 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Fndc1E9Q043 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Fndc1E9Q043 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Fndc1E9Q043 Lce1e-201ENSMUST00000090867 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Fndc1E9Q043 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Fndc1E9Q043 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Fndc1E9Q043 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Fndc1E9Q043 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Fndc1E9Q043 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Fndc1E9Q043 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Fndc1E9Q043 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Fndc1E9Q043 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Fndc1E9Q043 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Fndc1E9Q043 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Fndc1E9Q043 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Fndc1E9Q043 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Fndc1E9Q043 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Fndc1E9Q043 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Fndc1E9Q043 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Fndc1E9Q043 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Fndc1E9Q043 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Fndc1E9Q043 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Fndc1E9Q043 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Fndc1E9Q043 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Fndc1E9Q043 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Fndc1E9Q043 Nudt6-207ENSMUST00000141438 899 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Fndc1E9Q043 Gm28760-202ENSMUST00000190376 481 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Fndc1E9Q043 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Fndc1E9Q043 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Fndc1E9Q043 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Fndc1E9Q043 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Fndc1E9Q043 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Fndc1E9Q043 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Fndc1E9Q043 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Fndc1E9Q043 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Fndc1E9Q043 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Fndc1E9Q043 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Fndc1E9Q043 Trpm2-201ENSMUST00000105399 731 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Fndc1E9Q043 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Fndc1E9Q043 Gm16308-201ENSMUST00000162171 940 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Fndc1E9Q043 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Fndc1E9Q043 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Fndc1E9Q043 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Fndc1E9Q043 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Fndc1E9Q043 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Fndc1E9Q043 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Fndc1E9Q043 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Fndc1E9Q043 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Fndc1E9Q043 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Fndc1E9Q043 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Fndc1E9Q043 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Fndc1E9Q043 Plp2-201ENSMUST00000033486 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Fndc1E9Q043 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Fndc1E9Q043 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Fndc1E9Q043 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Fndc1E9Q043 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Fndc1E9Q043 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Fndc1E9Q043 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Fndc1E9Q043 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
Fndc1E9Q043 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Fndc1E9Q043 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Fndc1E9Q043 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Fndc1E9Q043 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Fndc1E9Q043 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Fndc1E9Q043 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Fndc1E9Q043 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Fndc1E9Q043 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Fndc1E9Q043 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Fndc1E9Q043 Gm14965-201ENSMUST00000124118 565 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Fndc1E9Q043 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Fndc1E9Q043 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Fndc1E9Q043 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Fndc1E9Q043 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Fndc1E9Q043 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Fndc1E9Q043 CT025551.1-201ENSMUST00000223996 692 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Fndc1E9Q043 AC134869.3-201ENSMUST00000225581 343 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Fndc1E9Q043 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Fndc1E9Q043 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Fndc1E9Q043 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Fndc1E9Q043 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Fndc1E9Q043 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Fndc1E9Q043 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Fndc1E9Q043 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Fndc1E9Q043 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms