Protein–RNA interactions for Protein: E9PXF8

Sbf2, SET-binding factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sbf2E9PXF8 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sbf2E9PXF8 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sbf2E9PXF8 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sbf2E9PXF8 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Sbf2E9PXF8 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sbf2E9PXF8 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sbf2E9PXF8 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sbf2E9PXF8 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sbf2E9PXF8 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sbf2E9PXF8 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sbf2E9PXF8 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sbf2E9PXF8 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sbf2E9PXF8 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sbf2E9PXF8 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sbf2E9PXF8 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sbf2E9PXF8 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sbf2E9PXF8 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sbf2E9PXF8 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sbf2E9PXF8 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Sbf2E9PXF8 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sbf2E9PXF8 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Sbf2E9PXF8 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Sbf2E9PXF8 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sbf2E9PXF8 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sbf2E9PXF8 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Sbf2E9PXF8 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sbf2E9PXF8 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Sbf2E9PXF8 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Sbf2E9PXF8 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sbf2E9PXF8 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sbf2E9PXF8 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sbf2E9PXF8 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sbf2E9PXF8 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sbf2E9PXF8 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sbf2E9PXF8 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sbf2E9PXF8 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sbf2E9PXF8 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sbf2E9PXF8 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sbf2E9PXF8 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Sbf2E9PXF8 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sbf2E9PXF8 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Sbf2E9PXF8 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Sbf2E9PXF8 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Sbf2E9PXF8 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sbf2E9PXF8 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sbf2E9PXF8 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sbf2E9PXF8 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sbf2E9PXF8 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sbf2E9PXF8 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sbf2E9PXF8 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sbf2E9PXF8 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sbf2E9PXF8 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sbf2E9PXF8 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sbf2E9PXF8 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sbf2E9PXF8 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sbf2E9PXF8 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sbf2E9PXF8 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sbf2E9PXF8 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sbf2E9PXF8 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sbf2E9PXF8 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sbf2E9PXF8 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sbf2E9PXF8 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sbf2E9PXF8 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sbf2E9PXF8 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Sbf2E9PXF8 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Sbf2E9PXF8 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sbf2E9PXF8 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Sbf2E9PXF8 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Sbf2E9PXF8 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Sbf2E9PXF8 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Sbf2E9PXF8 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Sbf2E9PXF8 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sbf2E9PXF8 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sbf2E9PXF8 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sbf2E9PXF8 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sbf2E9PXF8 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sbf2E9PXF8 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sbf2E9PXF8 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sbf2E9PXF8 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sbf2E9PXF8 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sbf2E9PXF8 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Sbf2E9PXF8 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Sbf2E9PXF8 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Sbf2E9PXF8 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Sbf2E9PXF8 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Sbf2E9PXF8 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Sbf2E9PXF8 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sbf2E9PXF8 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sbf2E9PXF8 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Sbf2E9PXF8 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Sbf2E9PXF8 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sbf2E9PXF8 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sbf2E9PXF8 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sbf2E9PXF8 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sbf2E9PXF8 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Sbf2E9PXF8 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sbf2E9PXF8 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sbf2E9PXF8 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sbf2E9PXF8 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Sbf2E9PXF8 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.7 ms