Protein–RNA interactions for Protein: E9PXC0

Srp54b, Signal recognition particle 54 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp54bE9PXC0 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Srp54bE9PXC0 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Srp54bE9PXC0 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Srp54bE9PXC0 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Srp54bE9PXC0 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Srp54bE9PXC0 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Srp54bE9PXC0 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Srp54bE9PXC0 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Srp54bE9PXC0 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Srp54bE9PXC0 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Srp54bE9PXC0 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Srp54bE9PXC0 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Srp54bE9PXC0 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Srp54bE9PXC0 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Srp54bE9PXC0 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Srp54bE9PXC0 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Srp54bE9PXC0 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Srp54bE9PXC0 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Srp54bE9PXC0 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Srp54bE9PXC0 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Srp54bE9PXC0 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Srp54bE9PXC0 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Srp54bE9PXC0 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Srp54bE9PXC0 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Srp54bE9PXC0 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Srp54bE9PXC0 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Srp54bE9PXC0 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Srp54bE9PXC0 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Srp54bE9PXC0 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Srp54bE9PXC0 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Srp54bE9PXC0 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Srp54bE9PXC0 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Srp54bE9PXC0 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Srp54bE9PXC0 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Srp54bE9PXC0 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Srp54bE9PXC0 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Srp54bE9PXC0 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Srp54bE9PXC0 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Srp54bE9PXC0 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Srp54bE9PXC0 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Srp54bE9PXC0 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Srp54bE9PXC0 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Srp54bE9PXC0 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Srp54bE9PXC0 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Srp54bE9PXC0 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Srp54bE9PXC0 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Srp54bE9PXC0 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Srp54bE9PXC0 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Srp54bE9PXC0 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Srp54bE9PXC0 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Srp54bE9PXC0 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Srp54bE9PXC0 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Srp54bE9PXC0 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Srp54bE9PXC0 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Srp54bE9PXC0 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Srp54bE9PXC0 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Srp54bE9PXC0 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Srp54bE9PXC0 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Srp54bE9PXC0 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Srp54bE9PXC0 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Srp54bE9PXC0 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Srp54bE9PXC0 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Srp54bE9PXC0 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Srp54bE9PXC0 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Srp54bE9PXC0 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Srp54bE9PXC0 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Srp54bE9PXC0 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Srp54bE9PXC0 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Srp54bE9PXC0 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Srp54bE9PXC0 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Srp54bE9PXC0 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Srp54bE9PXC0 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Srp54bE9PXC0 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Srp54bE9PXC0 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Srp54bE9PXC0 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Srp54bE9PXC0 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Srp54bE9PXC0 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Srp54bE9PXC0 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Srp54bE9PXC0 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Srp54bE9PXC0 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Srp54bE9PXC0 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Srp54bE9PXC0 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Srp54bE9PXC0 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Srp54bE9PXC0 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Srp54bE9PXC0 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Srp54bE9PXC0 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Srp54bE9PXC0 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Srp54bE9PXC0 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Srp54bE9PXC0 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Srp54bE9PXC0 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Srp54bE9PXC0 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Srp54bE9PXC0 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Srp54bE9PXC0 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Srp54bE9PXC0 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Srp54bE9PXC0 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Srp54bE9PXC0 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Srp54bE9PXC0 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Srp54bE9PXC0 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Srp54bE9PXC0 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Srp54bE9PXC0 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms