Protein–RNA interactions for Protein: D3YYI7

Rnf217, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF217, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf217D3YYI7 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rnf217D3YYI7 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rnf217D3YYI7 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rnf217D3YYI7 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rnf217D3YYI7 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rnf217D3YYI7 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rnf217D3YYI7 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rnf217D3YYI7 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rnf217D3YYI7 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rnf217D3YYI7 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rnf217D3YYI7 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rnf217D3YYI7 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rnf217D3YYI7 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rnf217D3YYI7 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rnf217D3YYI7 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rnf217D3YYI7 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rnf217D3YYI7 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rnf217D3YYI7 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rnf217D3YYI7 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rnf217D3YYI7 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rnf217D3YYI7 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Rnf217D3YYI7 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rnf217D3YYI7 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Rnf217D3YYI7 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Rnf217D3YYI7 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Rnf217D3YYI7 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rnf217D3YYI7 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rnf217D3YYI7 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rnf217D3YYI7 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rnf217D3YYI7 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rnf217D3YYI7 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Rnf217D3YYI7 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rnf217D3YYI7 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rnf217D3YYI7 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rnf217D3YYI7 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rnf217D3YYI7 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rnf217D3YYI7 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Rnf217D3YYI7 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Rnf217D3YYI7 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Rnf217D3YYI7 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rnf217D3YYI7 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rnf217D3YYI7 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rnf217D3YYI7 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rnf217D3YYI7 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rnf217D3YYI7 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rnf217D3YYI7 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rnf217D3YYI7 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Rnf217D3YYI7 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rnf217D3YYI7 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rnf217D3YYI7 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rnf217D3YYI7 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rnf217D3YYI7 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rnf217D3YYI7 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rnf217D3YYI7 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rnf217D3YYI7 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rnf217D3YYI7 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rnf217D3YYI7 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Rnf217D3YYI7 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rnf217D3YYI7 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rnf217D3YYI7 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rnf217D3YYI7 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rnf217D3YYI7 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rnf217D3YYI7 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rnf217D3YYI7 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rnf217D3YYI7 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rnf217D3YYI7 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rnf217D3YYI7 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rnf217D3YYI7 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rnf217D3YYI7 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rnf217D3YYI7 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rnf217D3YYI7 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rnf217D3YYI7 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Rnf217D3YYI7 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rnf217D3YYI7 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rnf217D3YYI7 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Rnf217D3YYI7 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Rnf217D3YYI7 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rnf217D3YYI7 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rnf217D3YYI7 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rnf217D3YYI7 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rnf217D3YYI7 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rnf217D3YYI7 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rnf217D3YYI7 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rnf217D3YYI7 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rnf217D3YYI7 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rnf217D3YYI7 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rnf217D3YYI7 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rnf217D3YYI7 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rnf217D3YYI7 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rnf217D3YYI7 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rnf217D3YYI7 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rnf217D3YYI7 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rnf217D3YYI7 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rnf217D3YYI7 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rnf217D3YYI7 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rnf217D3YYI7 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rnf217D3YYI7 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rnf217D3YYI7 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rnf217D3YYI7 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Rnf217D3YYI7 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
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