Protein–RNA interactions for Protein: D3YXS5

Kif28p, Kinesin-like protein KIF28P, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif28pD3YXS5 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Kif28pD3YXS5 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Kif28pD3YXS5 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Kif28pD3YXS5 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Kif28pD3YXS5 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Kif28pD3YXS5 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Kif28pD3YXS5 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Kif28pD3YXS5 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Kif28pD3YXS5 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Kif28pD3YXS5 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Kif28pD3YXS5 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Kif28pD3YXS5 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Kif28pD3YXS5 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Kif28pD3YXS5 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Kif28pD3YXS5 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Kif28pD3YXS5 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Kif28pD3YXS5 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Kif28pD3YXS5 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Kif28pD3YXS5 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Kif28pD3YXS5 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Kif28pD3YXS5 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Kif28pD3YXS5 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Kif28pD3YXS5 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Kif28pD3YXS5 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Kif28pD3YXS5 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Kif28pD3YXS5 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Kif28pD3YXS5 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Kif28pD3YXS5 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Kif28pD3YXS5 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Kif28pD3YXS5 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Kif28pD3YXS5 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Kif28pD3YXS5 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Kif28pD3YXS5 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Kif28pD3YXS5 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Kif28pD3YXS5 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Kif28pD3YXS5 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Kif28pD3YXS5 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Kif28pD3YXS5 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Kif28pD3YXS5 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Kif28pD3YXS5 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Kif28pD3YXS5 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Kif28pD3YXS5 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Kif28pD3YXS5 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Kif28pD3YXS5 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Kif28pD3YXS5 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Kif28pD3YXS5 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Kif28pD3YXS5 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Kif28pD3YXS5 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Kif28pD3YXS5 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Kif28pD3YXS5 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Kif28pD3YXS5 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Kif28pD3YXS5 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Kif28pD3YXS5 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Kif28pD3YXS5 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Kif28pD3YXS5 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Kif28pD3YXS5 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Kif28pD3YXS5 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Kif28pD3YXS5 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Kif28pD3YXS5 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Kif28pD3YXS5 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Kif28pD3YXS5 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Kif28pD3YXS5 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Kif28pD3YXS5 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Kif28pD3YXS5 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Kif28pD3YXS5 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Kif28pD3YXS5 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Kif28pD3YXS5 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Kif28pD3YXS5 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Kif28pD3YXS5 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Kif28pD3YXS5 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Kif28pD3YXS5 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Kif28pD3YXS5 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Kif28pD3YXS5 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Kif28pD3YXS5 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Kif28pD3YXS5 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Kif28pD3YXS5 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Kif28pD3YXS5 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Kif28pD3YXS5 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Kif28pD3YXS5 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Kif28pD3YXS5 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Kif28pD3YXS5 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Kif28pD3YXS5 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Kif28pD3YXS5 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Kif28pD3YXS5 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Kif28pD3YXS5 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Kif28pD3YXS5 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Kif28pD3YXS5 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Kif28pD3YXS5 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Kif28pD3YXS5 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Kif28pD3YXS5 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Kif28pD3YXS5 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Kif28pD3YXS5 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Kif28pD3YXS5 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Kif28pD3YXS5 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Kif28pD3YXS5 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Kif28pD3YXS5 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Kif28pD3YXS5 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Kif28pD3YXS5 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Kif28pD3YXS5 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Kif28pD3YXS5 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms