Protein–RNA interactions for Protein: D3YUM8

Gm4950, Proteasome subunit beta type, mousemouse

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Length 205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Gm4950D3YUM8 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm4950D3YUM8 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm4950D3YUM8 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm4950D3YUM8 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm4950D3YUM8 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Gm4950D3YUM8 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Gm4950D3YUM8 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm4950D3YUM8 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm4950D3YUM8 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
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Gm4950D3YUM8 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm4950D3YUM8 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm4950D3YUM8 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm4950D3YUM8 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm4950D3YUM8 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm4950D3YUM8 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm4950D3YUM8 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm4950D3YUM8 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm4950D3YUM8 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm4950D3YUM8 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm4950D3YUM8 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm4950D3YUM8 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm4950D3YUM8 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm4950D3YUM8 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm4950D3YUM8 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm4950D3YUM8 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm4950D3YUM8 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm4950D3YUM8 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm4950D3YUM8 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms