Protein–RNA interactions for Protein: B9EHT4

Clip3, CAP-Gly domain-containing linker protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip3B9EHT4 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Clip3B9EHT4 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Clip3B9EHT4 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Clip3B9EHT4 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Clip3B9EHT4 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Clip3B9EHT4 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Clip3B9EHT4 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Clip3B9EHT4 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Clip3B9EHT4 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Clip3B9EHT4 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Clip3B9EHT4 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Clip3B9EHT4 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Clip3B9EHT4 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Clip3B9EHT4 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Clip3B9EHT4 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Clip3B9EHT4 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Clip3B9EHT4 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Clip3B9EHT4 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Clip3B9EHT4 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Clip3B9EHT4 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Clip3B9EHT4 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Clip3B9EHT4 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Clip3B9EHT4 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Clip3B9EHT4 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Clip3B9EHT4 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Clip3B9EHT4 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Clip3B9EHT4 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Clip3B9EHT4 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Clip3B9EHT4 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Clip3B9EHT4 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Clip3B9EHT4 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Clip3B9EHT4 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Clip3B9EHT4 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Clip3B9EHT4 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Clip3B9EHT4 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Clip3B9EHT4 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Clip3B9EHT4 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Clip3B9EHT4 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Clip3B9EHT4 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Clip3B9EHT4 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Clip3B9EHT4 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Clip3B9EHT4 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Clip3B9EHT4 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Clip3B9EHT4 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Clip3B9EHT4 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Clip3B9EHT4 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Clip3B9EHT4 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Clip3B9EHT4 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Clip3B9EHT4 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Clip3B9EHT4 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Clip3B9EHT4 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Clip3B9EHT4 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Clip3B9EHT4 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Clip3B9EHT4 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Clip3B9EHT4 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Clip3B9EHT4 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Clip3B9EHT4 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Clip3B9EHT4 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Clip3B9EHT4 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Clip3B9EHT4 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Clip3B9EHT4 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Clip3B9EHT4 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Clip3B9EHT4 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Clip3B9EHT4 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Clip3B9EHT4 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Clip3B9EHT4 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Clip3B9EHT4 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Clip3B9EHT4 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Clip3B9EHT4 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Clip3B9EHT4 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Clip3B9EHT4 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Clip3B9EHT4 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Clip3B9EHT4 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Clip3B9EHT4 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Clip3B9EHT4 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Clip3B9EHT4 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Clip3B9EHT4 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Clip3B9EHT4 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Clip3B9EHT4 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Clip3B9EHT4 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Clip3B9EHT4 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Clip3B9EHT4 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Clip3B9EHT4 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Clip3B9EHT4 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Clip3B9EHT4 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Clip3B9EHT4 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Clip3B9EHT4 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Clip3B9EHT4 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Clip3B9EHT4 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Clip3B9EHT4 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Clip3B9EHT4 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Clip3B9EHT4 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Clip3B9EHT4 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Clip3B9EHT4 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Clip3B9EHT4 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Clip3B9EHT4 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Clip3B9EHT4 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Clip3B9EHT4 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Clip3B9EHT4 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Clip3B9EHT4 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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