Protein–RNA interactions for Protein: B5KM66

Syce3, Synaptonemal complex central element protein 3, mousemouse

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Length 88 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce3B5KM66 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Syce3B5KM66 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Syce3B5KM66 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Syce3B5KM66 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Syce3B5KM66 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Syce3B5KM66 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Syce3B5KM66 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Syce3B5KM66 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Syce3B5KM66 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Syce3B5KM66 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Syce3B5KM66 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Syce3B5KM66 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Syce3B5KM66 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Syce3B5KM66 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Syce3B5KM66 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Syce3B5KM66 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Syce3B5KM66 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Syce3B5KM66 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Syce3B5KM66 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Syce3B5KM66 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Syce3B5KM66 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Syce3B5KM66 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Syce3B5KM66 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Syce3B5KM66 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Syce3B5KM66 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Syce3B5KM66 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Syce3B5KM66 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Syce3B5KM66 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Syce3B5KM66 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Syce3B5KM66 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Syce3B5KM66 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Syce3B5KM66 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Syce3B5KM66 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Syce3B5KM66 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Syce3B5KM66 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Syce3B5KM66 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Syce3B5KM66 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syce3B5KM66 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syce3B5KM66 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syce3B5KM66 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syce3B5KM66 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syce3B5KM66 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syce3B5KM66 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syce3B5KM66 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syce3B5KM66 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syce3B5KM66 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syce3B5KM66 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syce3B5KM66 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syce3B5KM66 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syce3B5KM66 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Syce3B5KM66 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syce3B5KM66 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syce3B5KM66 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syce3B5KM66 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Syce3B5KM66 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syce3B5KM66 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Syce3B5KM66 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syce3B5KM66 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syce3B5KM66 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syce3B5KM66 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syce3B5KM66 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syce3B5KM66 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syce3B5KM66 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syce3B5KM66 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syce3B5KM66 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syce3B5KM66 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syce3B5KM66 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syce3B5KM66 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syce3B5KM66 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syce3B5KM66 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syce3B5KM66 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Syce3B5KM66 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syce3B5KM66 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syce3B5KM66 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syce3B5KM66 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syce3B5KM66 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syce3B5KM66 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syce3B5KM66 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syce3B5KM66 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syce3B5KM66 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syce3B5KM66 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syce3B5KM66 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syce3B5KM66 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syce3B5KM66 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syce3B5KM66 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syce3B5KM66 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syce3B5KM66 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syce3B5KM66 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syce3B5KM66 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syce3B5KM66 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syce3B5KM66 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syce3B5KM66 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syce3B5KM66 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syce3B5KM66 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syce3B5KM66 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syce3B5KM66 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syce3B5KM66 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syce3B5KM66 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syce3B5KM66 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syce3B5KM66 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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