Protein–RNA interactions for Protein: B2RVW2

Clrn2, Clarin 2, mousemouse

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Length 232 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn2B2RVW2 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clrn2B2RVW2 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clrn2B2RVW2 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clrn2B2RVW2 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clrn2B2RVW2 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clrn2B2RVW2 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clrn2B2RVW2 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clrn2B2RVW2 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clrn2B2RVW2 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clrn2B2RVW2 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clrn2B2RVW2 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Clrn2B2RVW2 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clrn2B2RVW2 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clrn2B2RVW2 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clrn2B2RVW2 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clrn2B2RVW2 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clrn2B2RVW2 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clrn2B2RVW2 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clrn2B2RVW2 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clrn2B2RVW2 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clrn2B2RVW2 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Clrn2B2RVW2 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clrn2B2RVW2 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Clrn2B2RVW2 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clrn2B2RVW2 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clrn2B2RVW2 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clrn2B2RVW2 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clrn2B2RVW2 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clrn2B2RVW2 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clrn2B2RVW2 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clrn2B2RVW2 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clrn2B2RVW2 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clrn2B2RVW2 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clrn2B2RVW2 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clrn2B2RVW2 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clrn2B2RVW2 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clrn2B2RVW2 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clrn2B2RVW2 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clrn2B2RVW2 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clrn2B2RVW2 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clrn2B2RVW2 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clrn2B2RVW2 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clrn2B2RVW2 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clrn2B2RVW2 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clrn2B2RVW2 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Clrn2B2RVW2 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clrn2B2RVW2 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Clrn2B2RVW2 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Clrn2B2RVW2 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clrn2B2RVW2 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Clrn2B2RVW2 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clrn2B2RVW2 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clrn2B2RVW2 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Clrn2B2RVW2 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clrn2B2RVW2 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Clrn2B2RVW2 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clrn2B2RVW2 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clrn2B2RVW2 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clrn2B2RVW2 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clrn2B2RVW2 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clrn2B2RVW2 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clrn2B2RVW2 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clrn2B2RVW2 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clrn2B2RVW2 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clrn2B2RVW2 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clrn2B2RVW2 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clrn2B2RVW2 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clrn2B2RVW2 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clrn2B2RVW2 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clrn2B2RVW2 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clrn2B2RVW2 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clrn2B2RVW2 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clrn2B2RVW2 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Clrn2B2RVW2 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clrn2B2RVW2 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clrn2B2RVW2 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clrn2B2RVW2 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clrn2B2RVW2 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clrn2B2RVW2 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clrn2B2RVW2 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clrn2B2RVW2 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Clrn2B2RVW2 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clrn2B2RVW2 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clrn2B2RVW2 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Clrn2B2RVW2 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clrn2B2RVW2 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clrn2B2RVW2 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clrn2B2RVW2 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clrn2B2RVW2 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clrn2B2RVW2 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clrn2B2RVW2 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clrn2B2RVW2 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clrn2B2RVW2 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clrn2B2RVW2 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clrn2B2RVW2 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clrn2B2RVW2 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clrn2B2RVW2 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Clrn2B2RVW2 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Clrn2B2RVW2 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms